Protein–RNA interactions for Protein: Q33DR2

Pdss1, Decaprenyl-diphosphate synthase subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdss1Q33DR2 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pdss1Q33DR2 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pdss1Q33DR2 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pdss1Q33DR2 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pdss1Q33DR2 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pdss1Q33DR2 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pdss1Q33DR2 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pdss1Q33DR2 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pdss1Q33DR2 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pdss1Q33DR2 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pdss1Q33DR2 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pdss1Q33DR2 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pdss1Q33DR2 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Pdss1Q33DR2 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pdss1Q33DR2 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pdss1Q33DR2 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pdss1Q33DR2 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pdss1Q33DR2 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pdss1Q33DR2 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pdss1Q33DR2 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pdss1Q33DR2 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pdss1Q33DR2 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pdss1Q33DR2 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pdss1Q33DR2 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pdss1Q33DR2 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pdss1Q33DR2 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pdss1Q33DR2 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pdss1Q33DR2 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pdss1Q33DR2 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pdss1Q33DR2 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pdss1Q33DR2 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pdss1Q33DR2 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pdss1Q33DR2 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pdss1Q33DR2 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pdss1Q33DR2 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pdss1Q33DR2 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Pdss1Q33DR2 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pdss1Q33DR2 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pdss1Q33DR2 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pdss1Q33DR2 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pdss1Q33DR2 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pdss1Q33DR2 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pdss1Q33DR2 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Pdss1Q33DR2 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pdss1Q33DR2 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pdss1Q33DR2 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pdss1Q33DR2 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pdss1Q33DR2 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pdss1Q33DR2 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pdss1Q33DR2 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Pdss1Q33DR2 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pdss1Q33DR2 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pdss1Q33DR2 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pdss1Q33DR2 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pdss1Q33DR2 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pdss1Q33DR2 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pdss1Q33DR2 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pdss1Q33DR2 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pdss1Q33DR2 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pdss1Q33DR2 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pdss1Q33DR2 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pdss1Q33DR2 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pdss1Q33DR2 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pdss1Q33DR2 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pdss1Q33DR2 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pdss1Q33DR2 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pdss1Q33DR2 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pdss1Q33DR2 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pdss1Q33DR2 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pdss1Q33DR2 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pdss1Q33DR2 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pdss1Q33DR2 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pdss1Q33DR2 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pdss1Q33DR2 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pdss1Q33DR2 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pdss1Q33DR2 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pdss1Q33DR2 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pdss1Q33DR2 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pdss1Q33DR2 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pdss1Q33DR2 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pdss1Q33DR2 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pdss1Q33DR2 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pdss1Q33DR2 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Pdss1Q33DR2 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Pdss1Q33DR2 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pdss1Q33DR2 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pdss1Q33DR2 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pdss1Q33DR2 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pdss1Q33DR2 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pdss1Q33DR2 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pdss1Q33DR2 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Pdss1Q33DR2 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pdss1Q33DR2 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pdss1Q33DR2 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pdss1Q33DR2 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pdss1Q33DR2 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pdss1Q33DR2 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pdss1Q33DR2 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pdss1Q33DR2 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pdss1Q33DR2 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms