Protein–RNA interactions for Protein: Q14DL3

Lrriq3, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 633 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrriq3Q14DL3 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lrriq3Q14DL3 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lrriq3Q14DL3 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lrriq3Q14DL3 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lrriq3Q14DL3 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lrriq3Q14DL3 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lrriq3Q14DL3 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lrriq3Q14DL3 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lrriq3Q14DL3 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lrriq3Q14DL3 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lrriq3Q14DL3 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lrriq3Q14DL3 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lrriq3Q14DL3 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lrriq3Q14DL3 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lrriq3Q14DL3 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lrriq3Q14DL3 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lrriq3Q14DL3 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lrriq3Q14DL3 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lrriq3Q14DL3 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lrriq3Q14DL3 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lrriq3Q14DL3 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lrriq3Q14DL3 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lrriq3Q14DL3 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lrriq3Q14DL3 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lrriq3Q14DL3 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lrriq3Q14DL3 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lrriq3Q14DL3 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lrriq3Q14DL3 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lrriq3Q14DL3 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lrriq3Q14DL3 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lrriq3Q14DL3 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lrriq3Q14DL3 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lrriq3Q14DL3 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lrriq3Q14DL3 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lrriq3Q14DL3 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lrriq3Q14DL3 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lrriq3Q14DL3 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lrriq3Q14DL3 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lrriq3Q14DL3 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lrriq3Q14DL3 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lrriq3Q14DL3 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lrriq3Q14DL3 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lrriq3Q14DL3 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lrriq3Q14DL3 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lrriq3Q14DL3 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lrriq3Q14DL3 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lrriq3Q14DL3 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lrriq3Q14DL3 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lrriq3Q14DL3 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lrriq3Q14DL3 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lrriq3Q14DL3 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lrriq3Q14DL3 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lrriq3Q14DL3 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lrriq3Q14DL3 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lrriq3Q14DL3 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lrriq3Q14DL3 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lrriq3Q14DL3 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lrriq3Q14DL3 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lrriq3Q14DL3 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lrriq3Q14DL3 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lrriq3Q14DL3 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lrriq3Q14DL3 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lrriq3Q14DL3 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lrriq3Q14DL3 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lrriq3Q14DL3 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lrriq3Q14DL3 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lrriq3Q14DL3 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lrriq3Q14DL3 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Lrriq3Q14DL3 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lrriq3Q14DL3 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lrriq3Q14DL3 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Lrriq3Q14DL3 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lrriq3Q14DL3 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Lrriq3Q14DL3 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lrriq3Q14DL3 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lrriq3Q14DL3 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lrriq3Q14DL3 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lrriq3Q14DL3 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lrriq3Q14DL3 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lrriq3Q14DL3 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lrriq3Q14DL3 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lrriq3Q14DL3 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lrriq3Q14DL3 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lrriq3Q14DL3 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lrriq3Q14DL3 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Lrriq3Q14DL3 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Lrriq3Q14DL3 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lrriq3Q14DL3 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lrriq3Q14DL3 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lrriq3Q14DL3 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lrriq3Q14DL3 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lrriq3Q14DL3 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lrriq3Q14DL3 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lrriq3Q14DL3 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lrriq3Q14DL3 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lrriq3Q14DL3 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lrriq3Q14DL3 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lrriq3Q14DL3 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lrriq3Q14DL3 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lrriq3Q14DL3 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.4 ms