Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Rundc1Q0VDN7 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
Rundc1Q0VDN7 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Rundc1Q0VDN7 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Rundc1Q0VDN7 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
Rundc1Q0VDN7 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Rundc1Q0VDN7 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
Rundc1Q0VDN7 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
Rundc1Q0VDN7 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
Rundc1Q0VDN7 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Rundc1Q0VDN7 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
Rundc1Q0VDN7 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Rundc1Q0VDN7 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC31.01■■■□□ 2.55
Rundc1Q0VDN7 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Rundc1Q0VDN7 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Rundc1Q0VDN7 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Rundc1Q0VDN7 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Rundc1Q0VDN7 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Rundc1Q0VDN7 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Rundc1Q0VDN7 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Rundc1Q0VDN7 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC30.98■■■□□ 2.55
Rundc1Q0VDN7 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Rundc1Q0VDN7 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Rundc1Q0VDN7 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Rundc1Q0VDN7 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Rundc1Q0VDN7 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
Rundc1Q0VDN7 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Rundc1Q0VDN7 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
Rundc1Q0VDN7 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Rundc1Q0VDN7 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Rundc1Q0VDN7 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Rundc1Q0VDN7 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Rundc1Q0VDN7 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Rundc1Q0VDN7 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Rundc1Q0VDN7 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Rundc1Q0VDN7 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
Rundc1Q0VDN7 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Rundc1Q0VDN7 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
Rundc1Q0VDN7 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
Rundc1Q0VDN7 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Rundc1Q0VDN7 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Rundc1Q0VDN7 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Rundc1Q0VDN7 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC30.94■■■□□ 2.54
Rundc1Q0VDN7 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Rundc1Q0VDN7 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Rundc1Q0VDN7 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
Rundc1Q0VDN7 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC30.93■■■□□ 2.54
Rundc1Q0VDN7 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Rundc1Q0VDN7 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
Rundc1Q0VDN7 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Rundc1Q0VDN7 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Rundc1Q0VDN7 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Rundc1Q0VDN7 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Rundc1Q0VDN7 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Rundc1Q0VDN7 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Rundc1Q0VDN7 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
Rundc1Q0VDN7 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Rundc1Q0VDN7 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Rundc1Q0VDN7 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Rundc1Q0VDN7 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Rundc1Q0VDN7 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
Rundc1Q0VDN7 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Rundc1Q0VDN7 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
Rundc1Q0VDN7 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Rundc1Q0VDN7 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Rundc1Q0VDN7 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Rundc1Q0VDN7 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC30.89■■■□□ 2.54
Rundc1Q0VDN7 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC30.89■■■□□ 2.54
Rundc1Q0VDN7 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Rundc1Q0VDN7 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Rundc1Q0VDN7 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
Rundc1Q0VDN7 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Rundc1Q0VDN7 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Rundc1Q0VDN7 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Rundc1Q0VDN7 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Rundc1Q0VDN7 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Rundc1Q0VDN7 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Rundc1Q0VDN7 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
Rundc1Q0VDN7 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Rundc1Q0VDN7 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
Rundc1Q0VDN7 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Rundc1Q0VDN7 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Rundc1Q0VDN7 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
Rundc1Q0VDN7 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Rundc1Q0VDN7 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Rundc1Q0VDN7 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Rundc1Q0VDN7 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Rundc1Q0VDN7 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
Rundc1Q0VDN7 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Rundc1Q0VDN7 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Rundc1Q0VDN7 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
Rundc1Q0VDN7 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Rundc1Q0VDN7 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Rundc1Q0VDN7 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Rundc1Q0VDN7 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
Rundc1Q0VDN7 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Rundc1Q0VDN7 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Rundc1Q0VDN7 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Rundc1Q0VDN7 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Rundc1Q0VDN7 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms