Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBN2

Dsel, Dermatan-sulfate epimerase-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DselQ0VBN2 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DselQ0VBN2 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DselQ0VBN2 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DselQ0VBN2 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DselQ0VBN2 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
DselQ0VBN2 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DselQ0VBN2 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DselQ0VBN2 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DselQ0VBN2 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DselQ0VBN2 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DselQ0VBN2 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DselQ0VBN2 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DselQ0VBN2 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DselQ0VBN2 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DselQ0VBN2 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DselQ0VBN2 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DselQ0VBN2 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
DselQ0VBN2 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DselQ0VBN2 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DselQ0VBN2 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DselQ0VBN2 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DselQ0VBN2 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DselQ0VBN2 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DselQ0VBN2 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DselQ0VBN2 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DselQ0VBN2 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DselQ0VBN2 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
DselQ0VBN2 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
DselQ0VBN2 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
DselQ0VBN2 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
DselQ0VBN2 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DselQ0VBN2 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DselQ0VBN2 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DselQ0VBN2 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DselQ0VBN2 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DselQ0VBN2 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DselQ0VBN2 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
DselQ0VBN2 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DselQ0VBN2 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DselQ0VBN2 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DselQ0VBN2 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DselQ0VBN2 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DselQ0VBN2 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DselQ0VBN2 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DselQ0VBN2 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DselQ0VBN2 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DselQ0VBN2 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DselQ0VBN2 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DselQ0VBN2 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DselQ0VBN2 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DselQ0VBN2 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
DselQ0VBN2 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DselQ0VBN2 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DselQ0VBN2 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
DselQ0VBN2 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DselQ0VBN2 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DselQ0VBN2 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DselQ0VBN2 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
DselQ0VBN2 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
DselQ0VBN2 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DselQ0VBN2 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DselQ0VBN2 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DselQ0VBN2 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
DselQ0VBN2 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DselQ0VBN2 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
DselQ0VBN2 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DselQ0VBN2 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DselQ0VBN2 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DselQ0VBN2 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DselQ0VBN2 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DselQ0VBN2 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DselQ0VBN2 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DselQ0VBN2 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DselQ0VBN2 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DselQ0VBN2 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DselQ0VBN2 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DselQ0VBN2 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DselQ0VBN2 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DselQ0VBN2 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DselQ0VBN2 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DselQ0VBN2 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DselQ0VBN2 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DselQ0VBN2 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DselQ0VBN2 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DselQ0VBN2 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DselQ0VBN2 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DselQ0VBN2 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DselQ0VBN2 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DselQ0VBN2 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DselQ0VBN2 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DselQ0VBN2 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DselQ0VBN2 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DselQ0VBN2 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DselQ0VBN2 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DselQ0VBN2 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DselQ0VBN2 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DselQ0VBN2 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
DselQ0VBN2 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DselQ0VBN2 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DselQ0VBN2 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms