Protein–RNA interactions for Protein: Q0P678

Zc3h18, Zinc finger CCCH domain-containing protein 18, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 948 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zc3h18Q0P678 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Zc3h18Q0P678 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Zc3h18Q0P678 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Zc3h18Q0P678 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Zc3h18Q0P678 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Zc3h18Q0P678 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Zc3h18Q0P678 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Zc3h18Q0P678 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Zc3h18Q0P678 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Zc3h18Q0P678 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Zc3h18Q0P678 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Zc3h18Q0P678 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Zc3h18Q0P678 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Zc3h18Q0P678 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Zc3h18Q0P678 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Zc3h18Q0P678 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Zc3h18Q0P678 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Zc3h18Q0P678 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Zc3h18Q0P678 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Zc3h18Q0P678 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Zc3h18Q0P678 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Zc3h18Q0P678 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Zc3h18Q0P678 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Zc3h18Q0P678 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Zc3h18Q0P678 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Zc3h18Q0P678 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Zc3h18Q0P678 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Zc3h18Q0P678 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Zc3h18Q0P678 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Zc3h18Q0P678 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Zc3h18Q0P678 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Zc3h18Q0P678 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Zc3h18Q0P678 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Zc3h18Q0P678 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Zc3h18Q0P678 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Zc3h18Q0P678 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Zc3h18Q0P678 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Zc3h18Q0P678 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Zc3h18Q0P678 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Zc3h18Q0P678 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Zc3h18Q0P678 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Zc3h18Q0P678 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Zc3h18Q0P678 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Zc3h18Q0P678 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Zc3h18Q0P678 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Zc3h18Q0P678 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Zc3h18Q0P678 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Zc3h18Q0P678 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Zc3h18Q0P678 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Zc3h18Q0P678 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Zc3h18Q0P678 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Zc3h18Q0P678 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Zc3h18Q0P678 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Zc3h18Q0P678 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Zc3h18Q0P678 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Zc3h18Q0P678 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Zc3h18Q0P678 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Zc3h18Q0P678 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Zc3h18Q0P678 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Zc3h18Q0P678 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Zc3h18Q0P678 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Zc3h18Q0P678 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Zc3h18Q0P678 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Zc3h18Q0P678 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Zc3h18Q0P678 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Zc3h18Q0P678 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Zc3h18Q0P678 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Zc3h18Q0P678 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Zc3h18Q0P678 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Zc3h18Q0P678 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Zc3h18Q0P678 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Zc3h18Q0P678 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Zc3h18Q0P678 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Zc3h18Q0P678 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Zc3h18Q0P678 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Zc3h18Q0P678 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Zc3h18Q0P678 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Zc3h18Q0P678 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Zc3h18Q0P678 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Zc3h18Q0P678 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Zc3h18Q0P678 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Zc3h18Q0P678 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Zc3h18Q0P678 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Zc3h18Q0P678 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Zc3h18Q0P678 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Zc3h18Q0P678 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Zc3h18Q0P678 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Zc3h18Q0P678 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Zc3h18Q0P678 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Zc3h18Q0P678 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Zc3h18Q0P678 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Zc3h18Q0P678 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Zc3h18Q0P678 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Zc3h18Q0P678 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Zc3h18Q0P678 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Zc3h18Q0P678 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Zc3h18Q0P678 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Zc3h18Q0P678 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Zc3h18Q0P678 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Zc3h18Q0P678 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms