Protein–RNA interactions for Protein: Q08652

Rbp2, Retinol-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp2Q08652 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rbp2Q08652 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rbp2Q08652 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rbp2Q08652 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rbp2Q08652 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rbp2Q08652 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rbp2Q08652 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rbp2Q08652 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Rbp2Q08652 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rbp2Q08652 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rbp2Q08652 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rbp2Q08652 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rbp2Q08652 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rbp2Q08652 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rbp2Q08652 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rbp2Q08652 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rbp2Q08652 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rbp2Q08652 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rbp2Q08652 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rbp2Q08652 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rbp2Q08652 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rbp2Q08652 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rbp2Q08652 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rbp2Q08652 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rbp2Q08652 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rbp2Q08652 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rbp2Q08652 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rbp2Q08652 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rbp2Q08652 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rbp2Q08652 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rbp2Q08652 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rbp2Q08652 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rbp2Q08652 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rbp2Q08652 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rbp2Q08652 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rbp2Q08652 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rbp2Q08652 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rbp2Q08652 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rbp2Q08652 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rbp2Q08652 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rbp2Q08652 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rbp2Q08652 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rbp2Q08652 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Rbp2Q08652 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rbp2Q08652 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Rbp2Q08652 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rbp2Q08652 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rbp2Q08652 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rbp2Q08652 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rbp2Q08652 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rbp2Q08652 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rbp2Q08652 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rbp2Q08652 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rbp2Q08652 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rbp2Q08652 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rbp2Q08652 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rbp2Q08652 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rbp2Q08652 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rbp2Q08652 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rbp2Q08652 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rbp2Q08652 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rbp2Q08652 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rbp2Q08652 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rbp2Q08652 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rbp2Q08652 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rbp2Q08652 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Rbp2Q08652 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rbp2Q08652 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rbp2Q08652 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rbp2Q08652 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rbp2Q08652 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rbp2Q08652 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rbp2Q08652 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rbp2Q08652 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rbp2Q08652 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Rbp2Q08652 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rbp2Q08652 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rbp2Q08652 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Rbp2Q08652 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rbp2Q08652 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Rbp2Q08652 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rbp2Q08652 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rbp2Q08652 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rbp2Q08652 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rbp2Q08652 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rbp2Q08652 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rbp2Q08652 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rbp2Q08652 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Rbp2Q08652 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rbp2Q08652 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rbp2Q08652 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rbp2Q08652 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rbp2Q08652 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rbp2Q08652 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rbp2Q08652 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Rbp2Q08652 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rbp2Q08652 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rbp2Q08652 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rbp2Q08652 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rbp2Q08652 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 112.2 ms