Protein–RNA interactions for Protein: Q05A13

Sdr16c6, Short-chain dehydrogenase/reductase family 16C member 6, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdr16c6Q05A13 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sdr16c6Q05A13 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sdr16c6Q05A13 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sdr16c6Q05A13 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sdr16c6Q05A13 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Sdr16c6Q05A13 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sdr16c6Q05A13 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sdr16c6Q05A13 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sdr16c6Q05A13 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sdr16c6Q05A13 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sdr16c6Q05A13 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sdr16c6Q05A13 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Sdr16c6Q05A13 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sdr16c6Q05A13 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sdr16c6Q05A13 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Sdr16c6Q05A13 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sdr16c6Q05A13 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sdr16c6Q05A13 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sdr16c6Q05A13 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sdr16c6Q05A13 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sdr16c6Q05A13 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sdr16c6Q05A13 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sdr16c6Q05A13 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sdr16c6Q05A13 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Sdr16c6Q05A13 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sdr16c6Q05A13 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sdr16c6Q05A13 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sdr16c6Q05A13 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sdr16c6Q05A13 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sdr16c6Q05A13 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sdr16c6Q05A13 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sdr16c6Q05A13 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sdr16c6Q05A13 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sdr16c6Q05A13 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sdr16c6Q05A13 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sdr16c6Q05A13 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sdr16c6Q05A13 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sdr16c6Q05A13 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sdr16c6Q05A13 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sdr16c6Q05A13 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sdr16c6Q05A13 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sdr16c6Q05A13 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sdr16c6Q05A13 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sdr16c6Q05A13 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sdr16c6Q05A13 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sdr16c6Q05A13 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sdr16c6Q05A13 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sdr16c6Q05A13 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sdr16c6Q05A13 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sdr16c6Q05A13 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sdr16c6Q05A13 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sdr16c6Q05A13 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sdr16c6Q05A13 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sdr16c6Q05A13 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sdr16c6Q05A13 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sdr16c6Q05A13 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sdr16c6Q05A13 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sdr16c6Q05A13 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sdr16c6Q05A13 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sdr16c6Q05A13 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sdr16c6Q05A13 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Sdr16c6Q05A13 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sdr16c6Q05A13 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sdr16c6Q05A13 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sdr16c6Q05A13 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sdr16c6Q05A13 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sdr16c6Q05A13 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sdr16c6Q05A13 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sdr16c6Q05A13 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Sdr16c6Q05A13 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sdr16c6Q05A13 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sdr16c6Q05A13 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sdr16c6Q05A13 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sdr16c6Q05A13 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sdr16c6Q05A13 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sdr16c6Q05A13 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sdr16c6Q05A13 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sdr16c6Q05A13 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sdr16c6Q05A13 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sdr16c6Q05A13 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sdr16c6Q05A13 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sdr16c6Q05A13 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sdr16c6Q05A13 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sdr16c6Q05A13 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sdr16c6Q05A13 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sdr16c6Q05A13 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sdr16c6Q05A13 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sdr16c6Q05A13 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sdr16c6Q05A13 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sdr16c6Q05A13 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sdr16c6Q05A13 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sdr16c6Q05A13 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sdr16c6Q05A13 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sdr16c6Q05A13 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sdr16c6Q05A13 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sdr16c6Q05A13 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sdr16c6Q05A13 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sdr16c6Q05A13 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sdr16c6Q05A13 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sdr16c6Q05A13 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms