Protein–RNA interactions for Protein: Q02242

Pdcd1, Programmed cell death protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd1Q02242 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pdcd1Q02242 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pdcd1Q02242 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pdcd1Q02242 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pdcd1Q02242 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pdcd1Q02242 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pdcd1Q02242 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pdcd1Q02242 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pdcd1Q02242 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pdcd1Q02242 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Pdcd1Q02242 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pdcd1Q02242 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pdcd1Q02242 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pdcd1Q02242 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pdcd1Q02242 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pdcd1Q02242 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pdcd1Q02242 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pdcd1Q02242 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pdcd1Q02242 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pdcd1Q02242 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pdcd1Q02242 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pdcd1Q02242 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pdcd1Q02242 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pdcd1Q02242 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pdcd1Q02242 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pdcd1Q02242 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pdcd1Q02242 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pdcd1Q02242 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pdcd1Q02242 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pdcd1Q02242 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pdcd1Q02242 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pdcd1Q02242 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Pdcd1Q02242 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pdcd1Q02242 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pdcd1Q02242 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pdcd1Q02242 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pdcd1Q02242 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pdcd1Q02242 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pdcd1Q02242 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pdcd1Q02242 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pdcd1Q02242 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pdcd1Q02242 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pdcd1Q02242 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pdcd1Q02242 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pdcd1Q02242 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pdcd1Q02242 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pdcd1Q02242 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Pdcd1Q02242 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pdcd1Q02242 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pdcd1Q02242 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Pdcd1Q02242 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Pdcd1Q02242 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pdcd1Q02242 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pdcd1Q02242 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pdcd1Q02242 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pdcd1Q02242 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pdcd1Q02242 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pdcd1Q02242 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pdcd1Q02242 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pdcd1Q02242 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pdcd1Q02242 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pdcd1Q02242 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pdcd1Q02242 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pdcd1Q02242 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pdcd1Q02242 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pdcd1Q02242 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pdcd1Q02242 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pdcd1Q02242 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pdcd1Q02242 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pdcd1Q02242 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pdcd1Q02242 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pdcd1Q02242 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pdcd1Q02242 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pdcd1Q02242 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pdcd1Q02242 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pdcd1Q02242 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pdcd1Q02242 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pdcd1Q02242 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pdcd1Q02242 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Pdcd1Q02242 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pdcd1Q02242 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pdcd1Q02242 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pdcd1Q02242 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pdcd1Q02242 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pdcd1Q02242 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pdcd1Q02242 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pdcd1Q02242 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pdcd1Q02242 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pdcd1Q02242 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pdcd1Q02242 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pdcd1Q02242 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pdcd1Q02242 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pdcd1Q02242 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pdcd1Q02242 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pdcd1Q02242 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pdcd1Q02242 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pdcd1Q02242 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pdcd1Q02242 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Pdcd1Q02242 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pdcd1Q02242 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.4 ms