Protein–RNA interactions for Protein: Q00690

Sele, E-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeleQ00690 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SeleQ00690 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SeleQ00690 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SeleQ00690 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SeleQ00690 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SeleQ00690 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SeleQ00690 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SeleQ00690 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SeleQ00690 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SeleQ00690 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SeleQ00690 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SeleQ00690 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SeleQ00690 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SeleQ00690 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SeleQ00690 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SeleQ00690 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SeleQ00690 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SeleQ00690 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SeleQ00690 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SeleQ00690 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SeleQ00690 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SeleQ00690 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SeleQ00690 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SeleQ00690 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SeleQ00690 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SeleQ00690 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SeleQ00690 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SeleQ00690 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SeleQ00690 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SeleQ00690 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SeleQ00690 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SeleQ00690 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SeleQ00690 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SeleQ00690 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SeleQ00690 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SeleQ00690 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SeleQ00690 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SeleQ00690 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SeleQ00690 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SeleQ00690 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SeleQ00690 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SeleQ00690 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SeleQ00690 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SeleQ00690 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SeleQ00690 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SeleQ00690 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SeleQ00690 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SeleQ00690 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SeleQ00690 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SeleQ00690 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SeleQ00690 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SeleQ00690 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SeleQ00690 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SeleQ00690 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SeleQ00690 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SeleQ00690 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SeleQ00690 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SeleQ00690 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SeleQ00690 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SeleQ00690 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SeleQ00690 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SeleQ00690 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SeleQ00690 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SeleQ00690 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SeleQ00690 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SeleQ00690 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SeleQ00690 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SeleQ00690 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SeleQ00690 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SeleQ00690 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SeleQ00690 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SeleQ00690 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SeleQ00690 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SeleQ00690 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SeleQ00690 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SeleQ00690 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SeleQ00690 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SeleQ00690 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SeleQ00690 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SeleQ00690 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SeleQ00690 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SeleQ00690 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SeleQ00690 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SeleQ00690 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SeleQ00690 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SeleQ00690 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SeleQ00690 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SeleQ00690 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SeleQ00690 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SeleQ00690 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SeleQ00690 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SeleQ00690 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SeleQ00690 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SeleQ00690 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SeleQ00690 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SeleQ00690 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SeleQ00690 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SeleQ00690 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SeleQ00690 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SeleQ00690 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms