Protein–RNA interactions for Protein: P97784

Cry1, Cryptochrome-1, mousemouse

Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cry1P97784 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cry1P97784 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cry1P97784 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cry1P97784 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cry1P97784 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cry1P97784 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cry1P97784 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cry1P97784 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cry1P97784 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cry1P97784 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cry1P97784 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cry1P97784 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cry1P97784 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cry1P97784 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cry1P97784 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cry1P97784 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cry1P97784 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cry1P97784 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cry1P97784 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Cry1P97784 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cry1P97784 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cry1P97784 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cry1P97784 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cry1P97784 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cry1P97784 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cry1P97784 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cry1P97784 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Cry1P97784 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cry1P97784 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cry1P97784 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cry1P97784 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cry1P97784 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cry1P97784 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cry1P97784 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cry1P97784 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cry1P97784 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cry1P97784 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cry1P97784 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cry1P97784 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cry1P97784 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cry1P97784 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cry1P97784 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cry1P97784 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cry1P97784 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cry1P97784 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cry1P97784 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cry1P97784 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cry1P97784 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cry1P97784 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cry1P97784 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Cry1P97784 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cry1P97784 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Cry1P97784 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cry1P97784 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cry1P97784 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cry1P97784 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cry1P97784 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cry1P97784 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cry1P97784 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cry1P97784 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cry1P97784 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cry1P97784 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cry1P97784 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cry1P97784 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cry1P97784 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cry1P97784 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cry1P97784 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cry1P97784 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cry1P97784 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cry1P97784 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cry1P97784 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cry1P97784 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cry1P97784 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cry1P97784 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cry1P97784 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cry1P97784 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Cry1P97784 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cry1P97784 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cry1P97784 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Cry1P97784 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cry1P97784 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cry1P97784 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cry1P97784 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cry1P97784 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cry1P97784 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cry1P97784 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cry1P97784 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cry1P97784 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cry1P97784 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cry1P97784 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cry1P97784 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cry1P97784 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cry1P97784 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cry1P97784 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cry1P97784 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cry1P97784 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cry1P97784 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cry1P97784 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cry1P97784 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cry1P97784 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.4 ms