Protein–RNA interactions for Protein: P70289

Ptprv, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase V, mousemouse

Predictions only

Length 1,705 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprvP70289 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.45
PtprvP70289 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
PtprvP70289 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
PtprvP70289 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
PtprvP70289 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
PtprvP70289 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
PtprvP70289 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
PtprvP70289 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
PtprvP70289 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC30.3■■■□□ 2.44
PtprvP70289 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
PtprvP70289 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
PtprvP70289 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
PtprvP70289 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
PtprvP70289 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
PtprvP70289 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
PtprvP70289 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
PtprvP70289 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
PtprvP70289 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
PtprvP70289 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
PtprvP70289 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC30.27■■■□□ 2.44
PtprvP70289 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
PtprvP70289 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
PtprvP70289 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
PtprvP70289 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
PtprvP70289 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
PtprvP70289 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC30.25■■■□□ 2.43
PtprvP70289 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
PtprvP70289 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC30.24■■■□□ 2.43
PtprvP70289 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC30.24■■■□□ 2.43
PtprvP70289 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC30.24■■■□□ 2.43
PtprvP70289 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
PtprvP70289 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
PtprvP70289 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
PtprvP70289 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
PtprvP70289 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
PtprvP70289 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
PtprvP70289 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
PtprvP70289 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
PtprvP70289 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
PtprvP70289 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
PtprvP70289 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
PtprvP70289 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
PtprvP70289 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
PtprvP70289 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
PtprvP70289 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
PtprvP70289 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
PtprvP70289 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
PtprvP70289 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
PtprvP70289 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
PtprvP70289 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
PtprvP70289 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
PtprvP70289 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
PtprvP70289 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
PtprvP70289 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
PtprvP70289 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
PtprvP70289 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
PtprvP70289 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC30.15■■■□□ 2.42
PtprvP70289 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
PtprvP70289 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
PtprvP70289 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
PtprvP70289 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
PtprvP70289 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
PtprvP70289 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
PtprvP70289 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
PtprvP70289 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
PtprvP70289 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
PtprvP70289 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
PtprvP70289 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
PtprvP70289 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
PtprvP70289 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
PtprvP70289 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
PtprvP70289 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
PtprvP70289 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
PtprvP70289 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
PtprvP70289 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
PtprvP70289 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
PtprvP70289 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
PtprvP70289 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
PtprvP70289 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
PtprvP70289 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
PtprvP70289 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
PtprvP70289 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
PtprvP70289 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
PtprvP70289 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
PtprvP70289 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
PtprvP70289 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
PtprvP70289 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
PtprvP70289 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
PtprvP70289 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
PtprvP70289 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
PtprvP70289 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
PtprvP70289 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
PtprvP70289 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
PtprvP70289 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
PtprvP70289 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
PtprvP70289 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
PtprvP70289 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
PtprvP70289 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
PtprvP70289 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
PtprvP70289 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms