Protein–RNA interactions for Protein: P70289

Ptprv, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase V, mousemouse

Predictions only

Length 1,705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprvP70289 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.45
PtprvP70289 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
PtprvP70289 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
PtprvP70289 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
PtprvP70289 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
PtprvP70289 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
PtprvP70289 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
PtprvP70289 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
PtprvP70289 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC30.3■■■□□ 2.44
PtprvP70289 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
PtprvP70289 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
PtprvP70289 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
PtprvP70289 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
PtprvP70289 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
PtprvP70289 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
PtprvP70289 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
PtprvP70289 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
PtprvP70289 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
PtprvP70289 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
PtprvP70289 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC30.27■■■□□ 2.44
PtprvP70289 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
PtprvP70289 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
PtprvP70289 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
PtprvP70289 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
PtprvP70289 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
PtprvP70289 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC30.25■■■□□ 2.43
PtprvP70289 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
PtprvP70289 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC30.24■■■□□ 2.43
PtprvP70289 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC30.24■■■□□ 2.43
PtprvP70289 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC30.24■■■□□ 2.43
PtprvP70289 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
PtprvP70289 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
PtprvP70289 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
PtprvP70289 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
PtprvP70289 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
PtprvP70289 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
PtprvP70289 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
PtprvP70289 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
PtprvP70289 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
PtprvP70289 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
PtprvP70289 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
PtprvP70289 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
PtprvP70289 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
PtprvP70289 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
PtprvP70289 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
PtprvP70289 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
PtprvP70289 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
PtprvP70289 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
PtprvP70289 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
PtprvP70289 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
PtprvP70289 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
PtprvP70289 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
PtprvP70289 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
PtprvP70289 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
PtprvP70289 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
PtprvP70289 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
PtprvP70289 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC30.15■■■□□ 2.42
PtprvP70289 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
PtprvP70289 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
PtprvP70289 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
PtprvP70289 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
PtprvP70289 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
PtprvP70289 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
PtprvP70289 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
PtprvP70289 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
PtprvP70289 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
PtprvP70289 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
PtprvP70289 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
PtprvP70289 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
PtprvP70289 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
PtprvP70289 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
PtprvP70289 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
PtprvP70289 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
PtprvP70289 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
PtprvP70289 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
PtprvP70289 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
PtprvP70289 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
PtprvP70289 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
PtprvP70289 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
PtprvP70289 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
PtprvP70289 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
PtprvP70289 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
PtprvP70289 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
PtprvP70289 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
PtprvP70289 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
PtprvP70289 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
PtprvP70289 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
PtprvP70289 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
PtprvP70289 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
PtprvP70289 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
PtprvP70289 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
PtprvP70289 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
PtprvP70289 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
PtprvP70289 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
PtprvP70289 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
PtprvP70289 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
PtprvP70289 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
PtprvP70289 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
PtprvP70289 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
PtprvP70289 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.4 ms