Protein–RNA interactions for Protein: P62274

Rps29, 40S ribosomal protein S29, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps29P62274 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rps29P62274 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Rps29P62274 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rps29P62274 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Rps29P62274 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rps29P62274 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rps29P62274 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rps29P62274 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rps29P62274 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rps29P62274 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rps29P62274 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rps29P62274 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Rps29P62274 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Rps29P62274 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Rps29P62274 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Rps29P62274 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Rps29P62274 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Rps29P62274 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Rps29P62274 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Rps29P62274 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rps29P62274 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rps29P62274 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rps29P62274 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rps29P62274 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rps29P62274 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rps29P62274 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rps29P62274 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rps29P62274 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rps29P62274 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Rps29P62274 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rps29P62274 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rps29P62274 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rps29P62274 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rps29P62274 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rps29P62274 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rps29P62274 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Rps29P62274 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rps29P62274 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rps29P62274 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rps29P62274 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rps29P62274 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rps29P62274 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rps29P62274 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rps29P62274 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rps29P62274 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rps29P62274 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rps29P62274 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rps29P62274 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Rps29P62274 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rps29P62274 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rps29P62274 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rps29P62274 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rps29P62274 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rps29P62274 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rps29P62274 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rps29P62274 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rps29P62274 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rps29P62274 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rps29P62274 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rps29P62274 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rps29P62274 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rps29P62274 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rps29P62274 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rps29P62274 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rps29P62274 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rps29P62274 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rps29P62274 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rps29P62274 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rps29P62274 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rps29P62274 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rps29P62274 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Rps29P62274 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Rps29P62274 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rps29P62274 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rps29P62274 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rps29P62274 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rps29P62274 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rps29P62274 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rps29P62274 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rps29P62274 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rps29P62274 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rps29P62274 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rps29P62274 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rps29P62274 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rps29P62274 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rps29P62274 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rps29P62274 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Rps29P62274 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Rps29P62274 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rps29P62274 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rps29P62274 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rps29P62274 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rps29P62274 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rps29P62274 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Rps29P62274 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rps29P62274 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rps29P62274 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rps29P62274 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rps29P62274 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Rps29P62274 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms