Protein–RNA interactions for Protein: P61967

Ap1s1, AP-1 complex subunit sigma-1A, mousemouse

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap1s1P61967 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ap1s1P61967 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ap1s1P61967 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ap1s1P61967 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ap1s1P61967 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ap1s1P61967 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ap1s1P61967 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ap1s1P61967 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ap1s1P61967 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ap1s1P61967 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ap1s1P61967 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ap1s1P61967 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ap1s1P61967 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ap1s1P61967 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ap1s1P61967 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ap1s1P61967 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ap1s1P61967 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ap1s1P61967 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ap1s1P61967 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ap1s1P61967 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ap1s1P61967 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ap1s1P61967 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ap1s1P61967 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ap1s1P61967 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Ap1s1P61967 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ap1s1P61967 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ap1s1P61967 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ap1s1P61967 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ap1s1P61967 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ap1s1P61967 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ap1s1P61967 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ap1s1P61967 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ap1s1P61967 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ap1s1P61967 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Ap1s1P61967 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Ap1s1P61967 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ap1s1P61967 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ap1s1P61967 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ap1s1P61967 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Ap1s1P61967 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ap1s1P61967 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ap1s1P61967 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ap1s1P61967 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ap1s1P61967 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ap1s1P61967 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ap1s1P61967 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ap1s1P61967 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ap1s1P61967 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ap1s1P61967 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ap1s1P61967 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ap1s1P61967 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Ap1s1P61967 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ap1s1P61967 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ap1s1P61967 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ap1s1P61967 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ap1s1P61967 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ap1s1P61967 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ap1s1P61967 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ap1s1P61967 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ap1s1P61967 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ap1s1P61967 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ap1s1P61967 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ap1s1P61967 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ap1s1P61967 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ap1s1P61967 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ap1s1P61967 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ap1s1P61967 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Ap1s1P61967 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ap1s1P61967 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ap1s1P61967 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ap1s1P61967 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ap1s1P61967 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ap1s1P61967 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ap1s1P61967 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Ap1s1P61967 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ap1s1P61967 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ap1s1P61967 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ap1s1P61967 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ap1s1P61967 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ap1s1P61967 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ap1s1P61967 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ap1s1P61967 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ap1s1P61967 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ap1s1P61967 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ap1s1P61967 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ap1s1P61967 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ap1s1P61967 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ap1s1P61967 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ap1s1P61967 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ap1s1P61967 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ap1s1P61967 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ap1s1P61967 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ap1s1P61967 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ap1s1P61967 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ap1s1P61967 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ap1s1P61967 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ap1s1P61967 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ap1s1P61967 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ap1s1P61967 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ap1s1P61967 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms