Protein–RNA interactions for Protein: P61622

Itga11, Integrin alpha-11, mousemouse

Predictions only

Length 1,188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga11P61622 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Itga11P61622 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Itga11P61622 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Itga11P61622 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Itga11P61622 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Itga11P61622 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Itga11P61622 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Itga11P61622 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Itga11P61622 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Itga11P61622 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Itga11P61622 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Itga11P61622 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Itga11P61622 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Itga11P61622 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Itga11P61622 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Itga11P61622 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Itga11P61622 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Itga11P61622 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Itga11P61622 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Itga11P61622 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Itga11P61622 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Itga11P61622 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Itga11P61622 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Itga11P61622 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Itga11P61622 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Itga11P61622 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Itga11P61622 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Itga11P61622 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Itga11P61622 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Itga11P61622 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Itga11P61622 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Itga11P61622 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Itga11P61622 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Itga11P61622 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Itga11P61622 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Itga11P61622 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Itga11P61622 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Itga11P61622 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Itga11P61622 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Itga11P61622 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Itga11P61622 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Itga11P61622 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Itga11P61622 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Itga11P61622 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Itga11P61622 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Itga11P61622 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Itga11P61622 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Itga11P61622 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Itga11P61622 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Itga11P61622 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Itga11P61622 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Itga11P61622 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Itga11P61622 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Itga11P61622 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Itga11P61622 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Itga11P61622 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Itga11P61622 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Itga11P61622 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Itga11P61622 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Itga11P61622 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Itga11P61622 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Itga11P61622 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Itga11P61622 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Itga11P61622 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Itga11P61622 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Itga11P61622 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Itga11P61622 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Itga11P61622 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Itga11P61622 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Itga11P61622 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Itga11P61622 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Itga11P61622 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Itga11P61622 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Itga11P61622 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Itga11P61622 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Itga11P61622 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Itga11P61622 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Itga11P61622 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Itga11P61622 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Itga11P61622 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Itga11P61622 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Itga11P61622 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Itga11P61622 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Itga11P61622 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Itga11P61622 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Itga11P61622 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Itga11P61622 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Itga11P61622 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Itga11P61622 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Itga11P61622 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Itga11P61622 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Itga11P61622 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
Itga11P61622 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Itga11P61622 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Itga11P61622 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Itga11P61622 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Itga11P61622 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Itga11P61622 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Itga11P61622 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Itga11P61622 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms