Protein–RNA interactions for Protein: P61407

Tdrd6, Tudor domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 2,134 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd6P61407 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tdrd6P61407 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tdrd6P61407 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tdrd6P61407 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tdrd6P61407 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tdrd6P61407 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tdrd6P61407 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tdrd6P61407 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tdrd6P61407 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tdrd6P61407 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tdrd6P61407 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tdrd6P61407 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tdrd6P61407 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tdrd6P61407 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tdrd6P61407 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tdrd6P61407 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tdrd6P61407 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tdrd6P61407 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tdrd6P61407 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tdrd6P61407 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tdrd6P61407 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tdrd6P61407 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tdrd6P61407 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Tdrd6P61407 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tdrd6P61407 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Tdrd6P61407 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tdrd6P61407 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tdrd6P61407 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tdrd6P61407 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tdrd6P61407 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tdrd6P61407 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tdrd6P61407 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Tdrd6P61407 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tdrd6P61407 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tdrd6P61407 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tdrd6P61407 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tdrd6P61407 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tdrd6P61407 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tdrd6P61407 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tdrd6P61407 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tdrd6P61407 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tdrd6P61407 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tdrd6P61407 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Tdrd6P61407 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tdrd6P61407 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tdrd6P61407 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tdrd6P61407 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tdrd6P61407 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tdrd6P61407 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tdrd6P61407 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tdrd6P61407 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tdrd6P61407 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tdrd6P61407 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tdrd6P61407 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tdrd6P61407 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tdrd6P61407 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tdrd6P61407 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tdrd6P61407 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tdrd6P61407 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tdrd6P61407 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tdrd6P61407 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tdrd6P61407 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tdrd6P61407 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tdrd6P61407 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Tdrd6P61407 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tdrd6P61407 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tdrd6P61407 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tdrd6P61407 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tdrd6P61407 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tdrd6P61407 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tdrd6P61407 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tdrd6P61407 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tdrd6P61407 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Tdrd6P61407 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tdrd6P61407 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tdrd6P61407 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tdrd6P61407 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tdrd6P61407 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tdrd6P61407 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tdrd6P61407 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tdrd6P61407 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Tdrd6P61407 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Tdrd6P61407 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tdrd6P61407 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tdrd6P61407 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tdrd6P61407 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Tdrd6P61407 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tdrd6P61407 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tdrd6P61407 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tdrd6P61407 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tdrd6P61407 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tdrd6P61407 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tdrd6P61407 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tdrd6P61407 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tdrd6P61407 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tdrd6P61407 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tdrd6P61407 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tdrd6P61407 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tdrd6P61407 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tdrd6P61407 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms