Protein–RNA interactions for Protein: P60521

Gabarapl2, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabarapl2P60521 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gabarapl2P60521 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gabarapl2P60521 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gabarapl2P60521 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gabarapl2P60521 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gabarapl2P60521 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gabarapl2P60521 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gabarapl2P60521 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gabarapl2P60521 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gabarapl2P60521 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gabarapl2P60521 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gabarapl2P60521 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gabarapl2P60521 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gabarapl2P60521 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gabarapl2P60521 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gabarapl2P60521 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gabarapl2P60521 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Gabarapl2P60521 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gabarapl2P60521 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gabarapl2P60521 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gabarapl2P60521 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gabarapl2P60521 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gabarapl2P60521 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gabarapl2P60521 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gabarapl2P60521 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gabarapl2P60521 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gabarapl2P60521 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gabarapl2P60521 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gabarapl2P60521 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gabarapl2P60521 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gabarapl2P60521 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gabarapl2P60521 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gabarapl2P60521 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gabarapl2P60521 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gabarapl2P60521 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gabarapl2P60521 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gabarapl2P60521 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gabarapl2P60521 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gabarapl2P60521 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gabarapl2P60521 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gabarapl2P60521 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gabarapl2P60521 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Gabarapl2P60521 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gabarapl2P60521 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gabarapl2P60521 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gabarapl2P60521 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gabarapl2P60521 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gabarapl2P60521 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Gabarapl2P60521 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gabarapl2P60521 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gabarapl2P60521 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gabarapl2P60521 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gabarapl2P60521 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Gabarapl2P60521 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Gabarapl2P60521 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gabarapl2P60521 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gabarapl2P60521 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gabarapl2P60521 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gabarapl2P60521 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gabarapl2P60521 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gabarapl2P60521 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Gabarapl2P60521 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gabarapl2P60521 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gabarapl2P60521 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gabarapl2P60521 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gabarapl2P60521 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gabarapl2P60521 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gabarapl2P60521 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gabarapl2P60521 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gabarapl2P60521 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gabarapl2P60521 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gabarapl2P60521 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gabarapl2P60521 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gabarapl2P60521 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gabarapl2P60521 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gabarapl2P60521 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gabarapl2P60521 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gabarapl2P60521 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gabarapl2P60521 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gabarapl2P60521 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gabarapl2P60521 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gabarapl2P60521 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gabarapl2P60521 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gabarapl2P60521 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gabarapl2P60521 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gabarapl2P60521 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gabarapl2P60521 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gabarapl2P60521 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gabarapl2P60521 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gabarapl2P60521 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gabarapl2P60521 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gabarapl2P60521 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gabarapl2P60521 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gabarapl2P60521 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gabarapl2P60521 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gabarapl2P60521 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gabarapl2P60521 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gabarapl2P60521 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Gabarapl2P60521 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Gabarapl2P60521 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.7 ms