Protein–RNA interactions for Protein: P59242

Cgn, Cingulin, mousemouse

Predictions only

Length 1,191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CgnP59242 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CgnP59242 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CgnP59242 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CgnP59242 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CgnP59242 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CgnP59242 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CgnP59242 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CgnP59242 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CgnP59242 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CgnP59242 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CgnP59242 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CgnP59242 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CgnP59242 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CgnP59242 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CgnP59242 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
CgnP59242 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CgnP59242 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CgnP59242 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CgnP59242 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CgnP59242 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CgnP59242 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CgnP59242 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CgnP59242 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CgnP59242 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CgnP59242 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CgnP59242 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CgnP59242 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CgnP59242 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CgnP59242 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CgnP59242 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CgnP59242 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CgnP59242 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CgnP59242 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CgnP59242 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CgnP59242 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CgnP59242 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CgnP59242 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CgnP59242 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CgnP59242 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CgnP59242 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CgnP59242 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CgnP59242 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CgnP59242 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CgnP59242 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CgnP59242 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CgnP59242 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CgnP59242 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CgnP59242 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CgnP59242 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CgnP59242 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CgnP59242 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CgnP59242 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CgnP59242 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CgnP59242 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CgnP59242 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CgnP59242 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CgnP59242 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CgnP59242 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CgnP59242 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
CgnP59242 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CgnP59242 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CgnP59242 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CgnP59242 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CgnP59242 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CgnP59242 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CgnP59242 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CgnP59242 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CgnP59242 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CgnP59242 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CgnP59242 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CgnP59242 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CgnP59242 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CgnP59242 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CgnP59242 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CgnP59242 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CgnP59242 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CgnP59242 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CgnP59242 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CgnP59242 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CgnP59242 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CgnP59242 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CgnP59242 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CgnP59242 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
CgnP59242 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CgnP59242 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CgnP59242 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CgnP59242 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CgnP59242 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CgnP59242 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CgnP59242 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CgnP59242 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CgnP59242 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CgnP59242 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CgnP59242 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CgnP59242 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CgnP59242 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CgnP59242 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CgnP59242 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CgnP59242 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CgnP59242 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.4 ms