Protein–RNA interactions for Protein: P58854

Tubgcp3, Gamma-tubulin complex component 3, mousemouse

Predictions only

Length 905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp3P58854 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tubgcp3P58854 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tubgcp3P58854 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tubgcp3P58854 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tubgcp3P58854 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tubgcp3P58854 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tubgcp3P58854 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tubgcp3P58854 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tubgcp3P58854 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tubgcp3P58854 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tubgcp3P58854 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tubgcp3P58854 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tubgcp3P58854 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Tubgcp3P58854 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tubgcp3P58854 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tubgcp3P58854 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tubgcp3P58854 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tubgcp3P58854 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Tubgcp3P58854 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tubgcp3P58854 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tubgcp3P58854 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Tubgcp3P58854 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tubgcp3P58854 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tubgcp3P58854 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tubgcp3P58854 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tubgcp3P58854 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tubgcp3P58854 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Tubgcp3P58854 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tubgcp3P58854 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tubgcp3P58854 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Tubgcp3P58854 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Tubgcp3P58854 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tubgcp3P58854 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tubgcp3P58854 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tubgcp3P58854 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tubgcp3P58854 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tubgcp3P58854 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tubgcp3P58854 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tubgcp3P58854 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tubgcp3P58854 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Tubgcp3P58854 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tubgcp3P58854 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tubgcp3P58854 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tubgcp3P58854 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tubgcp3P58854 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tubgcp3P58854 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tubgcp3P58854 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tubgcp3P58854 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tubgcp3P58854 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tubgcp3P58854 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tubgcp3P58854 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tubgcp3P58854 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tubgcp3P58854 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tubgcp3P58854 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Tubgcp3P58854 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tubgcp3P58854 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tubgcp3P58854 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tubgcp3P58854 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tubgcp3P58854 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tubgcp3P58854 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tubgcp3P58854 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tubgcp3P58854 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tubgcp3P58854 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tubgcp3P58854 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tubgcp3P58854 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tubgcp3P58854 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tubgcp3P58854 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tubgcp3P58854 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tubgcp3P58854 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tubgcp3P58854 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tubgcp3P58854 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tubgcp3P58854 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tubgcp3P58854 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tubgcp3P58854 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tubgcp3P58854 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tubgcp3P58854 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tubgcp3P58854 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tubgcp3P58854 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tubgcp3P58854 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tubgcp3P58854 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tubgcp3P58854 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tubgcp3P58854 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tubgcp3P58854 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tubgcp3P58854 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Tubgcp3P58854 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tubgcp3P58854 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tubgcp3P58854 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Tubgcp3P58854 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tubgcp3P58854 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tubgcp3P58854 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tubgcp3P58854 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tubgcp3P58854 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tubgcp3P58854 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tubgcp3P58854 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Tubgcp3P58854 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Tubgcp3P58854 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tubgcp3P58854 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tubgcp3P58854 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tubgcp3P58854 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tubgcp3P58854 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms