Protein–RNA interactions for Protein: P56581

Tdg, G/T mismatch-specific thymine DNA glycosylase, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TdgP56581 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TdgP56581 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TdgP56581 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TdgP56581 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TdgP56581 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TdgP56581 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TdgP56581 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TdgP56581 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TdgP56581 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TdgP56581 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TdgP56581 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TdgP56581 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TdgP56581 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TdgP56581 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TdgP56581 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TdgP56581 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TdgP56581 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
TdgP56581 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TdgP56581 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TdgP56581 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TdgP56581 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TdgP56581 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TdgP56581 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TdgP56581 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TdgP56581 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TdgP56581 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TdgP56581 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TdgP56581 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TdgP56581 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TdgP56581 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TdgP56581 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TdgP56581 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TdgP56581 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TdgP56581 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TdgP56581 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TdgP56581 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TdgP56581 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TdgP56581 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TdgP56581 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TdgP56581 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TdgP56581 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TdgP56581 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TdgP56581 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TdgP56581 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TdgP56581 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TdgP56581 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TdgP56581 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TdgP56581 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TdgP56581 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TdgP56581 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TdgP56581 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TdgP56581 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TdgP56581 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TdgP56581 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TdgP56581 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TdgP56581 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TdgP56581 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TdgP56581 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
TdgP56581 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
TdgP56581 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TdgP56581 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TdgP56581 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TdgP56581 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TdgP56581 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TdgP56581 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TdgP56581 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TdgP56581 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TdgP56581 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TdgP56581 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TdgP56581 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TdgP56581 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TdgP56581 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TdgP56581 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TdgP56581 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TdgP56581 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TdgP56581 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
TdgP56581 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TdgP56581 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TdgP56581 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
TdgP56581 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TdgP56581 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TdgP56581 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TdgP56581 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TdgP56581 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TdgP56581 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TdgP56581 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TdgP56581 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TdgP56581 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TdgP56581 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TdgP56581 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TdgP56581 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TdgP56581 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TdgP56581 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TdgP56581 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TdgP56581 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TdgP56581 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TdgP56581 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TdgP56581 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TdgP56581 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TdgP56581 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms