Protein–RNA interactions for Protein: P50704

Defa6, Alpha-defensin 6/12, mousemouse

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa6P50704 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Defa6P50704 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Defa6P50704 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Defa6P50704 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Defa6P50704 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Defa6P50704 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Defa6P50704 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Defa6P50704 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Defa6P50704 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Defa6P50704 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Defa6P50704 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Defa6P50704 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Defa6P50704 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Defa6P50704 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Defa6P50704 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Defa6P50704 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Defa6P50704 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Defa6P50704 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Defa6P50704 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Defa6P50704 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Defa6P50704 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Defa6P50704 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Defa6P50704 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Defa6P50704 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Defa6P50704 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Defa6P50704 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Defa6P50704 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Defa6P50704 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Defa6P50704 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Defa6P50704 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Defa6P50704 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Defa6P50704 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Defa6P50704 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Defa6P50704 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Defa6P50704 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Defa6P50704 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Defa6P50704 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Defa6P50704 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Defa6P50704 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Defa6P50704 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Defa6P50704 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Defa6P50704 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Defa6P50704 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Defa6P50704 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Defa6P50704 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Defa6P50704 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Defa6P50704 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Defa6P50704 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Defa6P50704 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Defa6P50704 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Defa6P50704 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Defa6P50704 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Defa6P50704 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Defa6P50704 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Defa6P50704 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Defa6P50704 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Defa6P50704 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Defa6P50704 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Defa6P50704 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Defa6P50704 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Defa6P50704 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Defa6P50704 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Defa6P50704 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Defa6P50704 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Defa6P50704 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Defa6P50704 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Defa6P50704 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Defa6P50704 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Defa6P50704 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Defa6P50704 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Defa6P50704 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Defa6P50704 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Defa6P50704 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Defa6P50704 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Defa6P50704 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Defa6P50704 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Defa6P50704 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Defa6P50704 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Defa6P50704 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Defa6P50704 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Defa6P50704 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Defa6P50704 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Defa6P50704 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Defa6P50704 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Defa6P50704 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Defa6P50704 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Defa6P50704 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Defa6P50704 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Defa6P50704 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Defa6P50704 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Defa6P50704 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Defa6P50704 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Defa6P50704 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Defa6P50704 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Defa6P50704 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Defa6P50704 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Defa6P50704 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Defa6P50704 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Defa6P50704 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Defa6P50704 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88 ms