Protein–RNA interactions for Protein: P47857

Pfkm, ATP-dependent 6-phosphofructokinase, muscle type, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PfkmP47857 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PfkmP47857 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PfkmP47857 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PfkmP47857 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PfkmP47857 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PfkmP47857 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PfkmP47857 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PfkmP47857 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PfkmP47857 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PfkmP47857 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PfkmP47857 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PfkmP47857 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PfkmP47857 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PfkmP47857 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PfkmP47857 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PfkmP47857 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PfkmP47857 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PfkmP47857 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PfkmP47857 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PfkmP47857 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PfkmP47857 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PfkmP47857 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PfkmP47857 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PfkmP47857 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PfkmP47857 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PfkmP47857 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PfkmP47857 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PfkmP47857 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PfkmP47857 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PfkmP47857 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PfkmP47857 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PfkmP47857 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PfkmP47857 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PfkmP47857 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PfkmP47857 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PfkmP47857 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PfkmP47857 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PfkmP47857 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PfkmP47857 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PfkmP47857 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PfkmP47857 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PfkmP47857 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PfkmP47857 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PfkmP47857 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PfkmP47857 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PfkmP47857 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PfkmP47857 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PfkmP47857 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PfkmP47857 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PfkmP47857 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PfkmP47857 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PfkmP47857 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PfkmP47857 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PfkmP47857 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PfkmP47857 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PfkmP47857 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PfkmP47857 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PfkmP47857 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PfkmP47857 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PfkmP47857 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PfkmP47857 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PfkmP47857 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PfkmP47857 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PfkmP47857 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PfkmP47857 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PfkmP47857 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PfkmP47857 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PfkmP47857 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PfkmP47857 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
PfkmP47857 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PfkmP47857 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PfkmP47857 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PfkmP47857 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PfkmP47857 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PfkmP47857 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PfkmP47857 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PfkmP47857 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PfkmP47857 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PfkmP47857 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PfkmP47857 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PfkmP47857 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PfkmP47857 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PfkmP47857 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PfkmP47857 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PfkmP47857 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PfkmP47857 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PfkmP47857 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PfkmP47857 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PfkmP47857 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PfkmP47857 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PfkmP47857 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PfkmP47857 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PfkmP47857 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PfkmP47857 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PfkmP47857 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PfkmP47857 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PfkmP47857 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PfkmP47857 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PfkmP47857 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PfkmP47857 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms