Protein–RNA interactions for Protein: P40226

Thpo, Thrombopoietin, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ThpoP40226 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ThpoP40226 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
ThpoP40226 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
ThpoP40226 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ThpoP40226 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ThpoP40226 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ThpoP40226 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ThpoP40226 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ThpoP40226 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ThpoP40226 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ThpoP40226 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ThpoP40226 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
ThpoP40226 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ThpoP40226 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ThpoP40226 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ThpoP40226 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ThpoP40226 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ThpoP40226 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ThpoP40226 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
ThpoP40226 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
ThpoP40226 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ThpoP40226 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ThpoP40226 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ThpoP40226 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ThpoP40226 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ThpoP40226 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ThpoP40226 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ThpoP40226 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ThpoP40226 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ThpoP40226 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ThpoP40226 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ThpoP40226 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ThpoP40226 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ThpoP40226 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ThpoP40226 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ThpoP40226 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ThpoP40226 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ThpoP40226 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ThpoP40226 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ThpoP40226 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ThpoP40226 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ThpoP40226 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ThpoP40226 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ThpoP40226 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ThpoP40226 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ThpoP40226 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ThpoP40226 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ThpoP40226 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ThpoP40226 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ThpoP40226 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ThpoP40226 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
ThpoP40226 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ThpoP40226 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ThpoP40226 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ThpoP40226 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ThpoP40226 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ThpoP40226 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ThpoP40226 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ThpoP40226 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ThpoP40226 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ThpoP40226 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ThpoP40226 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ThpoP40226 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
ThpoP40226 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ThpoP40226 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ThpoP40226 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
ThpoP40226 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
ThpoP40226 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ThpoP40226 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ThpoP40226 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ThpoP40226 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ThpoP40226 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ThpoP40226 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ThpoP40226 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ThpoP40226 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ThpoP40226 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ThpoP40226 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ThpoP40226 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ThpoP40226 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ThpoP40226 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ThpoP40226 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ThpoP40226 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ThpoP40226 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ThpoP40226 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ThpoP40226 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ThpoP40226 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ThpoP40226 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ThpoP40226 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ThpoP40226 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ThpoP40226 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ThpoP40226 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ThpoP40226 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ThpoP40226 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ThpoP40226 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
ThpoP40226 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ThpoP40226 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ThpoP40226 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ThpoP40226 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ThpoP40226 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ThpoP40226 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.5 ms