Protein–RNA interactions for Protein: P35235

Ptpn11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn11P35235 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ptpn11P35235 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ptpn11P35235 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ptpn11P35235 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ptpn11P35235 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ptpn11P35235 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Ptpn11P35235 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ptpn11P35235 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ptpn11P35235 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ptpn11P35235 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ptpn11P35235 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ptpn11P35235 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ptpn11P35235 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ptpn11P35235 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ptpn11P35235 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ptpn11P35235 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ptpn11P35235 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ptpn11P35235 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Ptpn11P35235 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ptpn11P35235 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ptpn11P35235 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ptpn11P35235 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ptpn11P35235 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ptpn11P35235 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ptpn11P35235 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ptpn11P35235 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ptpn11P35235 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ptpn11P35235 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ptpn11P35235 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ptpn11P35235 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ptpn11P35235 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ptpn11P35235 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ptpn11P35235 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ptpn11P35235 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ptpn11P35235 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ptpn11P35235 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ptpn11P35235 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ptpn11P35235 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ptpn11P35235 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ptpn11P35235 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Ptpn11P35235 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ptpn11P35235 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ptpn11P35235 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ptpn11P35235 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Ptpn11P35235 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ptpn11P35235 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ptpn11P35235 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ptpn11P35235 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ptpn11P35235 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ptpn11P35235 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ptpn11P35235 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ptpn11P35235 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ptpn11P35235 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ptpn11P35235 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ptpn11P35235 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ptpn11P35235 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ptpn11P35235 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ptpn11P35235 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ptpn11P35235 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ptpn11P35235 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ptpn11P35235 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ptpn11P35235 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Ptpn11P35235 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ptpn11P35235 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ptpn11P35235 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ptpn11P35235 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ptpn11P35235 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ptpn11P35235 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ptpn11P35235 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ptpn11P35235 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ptpn11P35235 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ptpn11P35235 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ptpn11P35235 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ptpn11P35235 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ptpn11P35235 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ptpn11P35235 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ptpn11P35235 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ptpn11P35235 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ptpn11P35235 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ptpn11P35235 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ptpn11P35235 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ptpn11P35235 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ptpn11P35235 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ptpn11P35235 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ptpn11P35235 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ptpn11P35235 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ptpn11P35235 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ptpn11P35235 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ptpn11P35235 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ptpn11P35235 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ptpn11P35235 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ptpn11P35235 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ptpn11P35235 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Ptpn11P35235 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ptpn11P35235 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ptpn11P35235 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ptpn11P35235 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ptpn11P35235 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ptpn11P35235 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ptpn11P35235 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms