Protein–RNA interactions for Protein: P33896

Ifnar1, Interferon alpha/beta receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifnar1P33896 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ifnar1P33896 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ifnar1P33896 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ifnar1P33896 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ifnar1P33896 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ifnar1P33896 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ifnar1P33896 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ifnar1P33896 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ifnar1P33896 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ifnar1P33896 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ifnar1P33896 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ifnar1P33896 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ifnar1P33896 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ifnar1P33896 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ifnar1P33896 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Ifnar1P33896 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Ifnar1P33896 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ifnar1P33896 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ifnar1P33896 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ifnar1P33896 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ifnar1P33896 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Ifnar1P33896 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ifnar1P33896 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ifnar1P33896 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ifnar1P33896 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ifnar1P33896 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ifnar1P33896 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Ifnar1P33896 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ifnar1P33896 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ifnar1P33896 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ifnar1P33896 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ifnar1P33896 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Ifnar1P33896 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ifnar1P33896 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ifnar1P33896 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ifnar1P33896 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ifnar1P33896 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ifnar1P33896 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ifnar1P33896 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ifnar1P33896 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ifnar1P33896 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ifnar1P33896 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ifnar1P33896 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ifnar1P33896 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ifnar1P33896 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ifnar1P33896 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ifnar1P33896 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ifnar1P33896 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ifnar1P33896 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ifnar1P33896 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ifnar1P33896 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ifnar1P33896 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ifnar1P33896 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ifnar1P33896 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ifnar1P33896 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Ifnar1P33896 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ifnar1P33896 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ifnar1P33896 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ifnar1P33896 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ifnar1P33896 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ifnar1P33896 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ifnar1P33896 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ifnar1P33896 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ifnar1P33896 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ifnar1P33896 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ifnar1P33896 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ifnar1P33896 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ifnar1P33896 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ifnar1P33896 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ifnar1P33896 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ifnar1P33896 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ifnar1P33896 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ifnar1P33896 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ifnar1P33896 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ifnar1P33896 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ifnar1P33896 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ifnar1P33896 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ifnar1P33896 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ifnar1P33896 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ifnar1P33896 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ifnar1P33896 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ifnar1P33896 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Ifnar1P33896 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ifnar1P33896 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ifnar1P33896 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ifnar1P33896 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ifnar1P33896 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ifnar1P33896 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ifnar1P33896 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ifnar1P33896 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ifnar1P33896 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ifnar1P33896 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ifnar1P33896 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ifnar1P33896 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ifnar1P33896 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ifnar1P33896 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ifnar1P33896 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ifnar1P33896 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ifnar1P33896 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ifnar1P33896 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.4 ms