Protein–RNA interactions for Protein: P29452

Casp1, Caspase-1, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp1P29452 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Casp1P29452 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Casp1P29452 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Casp1P29452 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Casp1P29452 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Casp1P29452 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Casp1P29452 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Casp1P29452 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Casp1P29452 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Casp1P29452 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Casp1P29452 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Casp1P29452 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Casp1P29452 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Casp1P29452 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Casp1P29452 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Casp1P29452 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Casp1P29452 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Casp1P29452 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Casp1P29452 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Casp1P29452 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Casp1P29452 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Casp1P29452 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Casp1P29452 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Casp1P29452 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Casp1P29452 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Casp1P29452 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Casp1P29452 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Casp1P29452 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Casp1P29452 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Casp1P29452 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Casp1P29452 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Casp1P29452 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Casp1P29452 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Casp1P29452 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Casp1P29452 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Casp1P29452 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Casp1P29452 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Casp1P29452 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Casp1P29452 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Casp1P29452 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Casp1P29452 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Casp1P29452 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Casp1P29452 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Casp1P29452 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Casp1P29452 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Casp1P29452 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Casp1P29452 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Casp1P29452 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Casp1P29452 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Casp1P29452 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Casp1P29452 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Casp1P29452 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Casp1P29452 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Casp1P29452 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Casp1P29452 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Casp1P29452 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Casp1P29452 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Casp1P29452 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Casp1P29452 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Casp1P29452 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Casp1P29452 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Casp1P29452 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Casp1P29452 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Casp1P29452 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Casp1P29452 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Casp1P29452 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Casp1P29452 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Casp1P29452 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Casp1P29452 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Casp1P29452 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Casp1P29452 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Casp1P29452 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Casp1P29452 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Casp1P29452 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Casp1P29452 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Casp1P29452 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Casp1P29452 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Casp1P29452 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Casp1P29452 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Casp1P29452 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Casp1P29452 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Casp1P29452 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Casp1P29452 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Casp1P29452 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Casp1P29452 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Casp1P29452 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Casp1P29452 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Casp1P29452 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Casp1P29452 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Casp1P29452 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Casp1P29452 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Casp1P29452 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Casp1P29452 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Casp1P29452 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Casp1P29452 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Casp1P29452 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Casp1P29452 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Casp1P29452 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Casp1P29452 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Casp1P29452 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.7 ms