Protein–RNA interactions for Protein: P19437

Ms4a1, B-lymphocyte antigen CD20, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a1P19437 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ms4a1P19437 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ms4a1P19437 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ms4a1P19437 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ms4a1P19437 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ms4a1P19437 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ms4a1P19437 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ms4a1P19437 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ms4a1P19437 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ms4a1P19437 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ms4a1P19437 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ms4a1P19437 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ms4a1P19437 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ms4a1P19437 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ms4a1P19437 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Ms4a1P19437 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ms4a1P19437 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ms4a1P19437 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ms4a1P19437 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Ms4a1P19437 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ms4a1P19437 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ms4a1P19437 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ms4a1P19437 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ms4a1P19437 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ms4a1P19437 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ms4a1P19437 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ms4a1P19437 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Ms4a1P19437 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ms4a1P19437 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ms4a1P19437 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ms4a1P19437 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ms4a1P19437 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ms4a1P19437 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ms4a1P19437 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ms4a1P19437 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ms4a1P19437 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ms4a1P19437 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ms4a1P19437 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ms4a1P19437 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ms4a1P19437 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Ms4a1P19437 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Ms4a1P19437 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Ms4a1P19437 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Ms4a1P19437 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ms4a1P19437 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Ms4a1P19437 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ms4a1P19437 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ms4a1P19437 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ms4a1P19437 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ms4a1P19437 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ms4a1P19437 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ms4a1P19437 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ms4a1P19437 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Ms4a1P19437 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ms4a1P19437 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ms4a1P19437 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ms4a1P19437 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ms4a1P19437 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ms4a1P19437 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ms4a1P19437 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ms4a1P19437 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Ms4a1P19437 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ms4a1P19437 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Ms4a1P19437 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ms4a1P19437 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ms4a1P19437 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ms4a1P19437 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ms4a1P19437 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ms4a1P19437 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ms4a1P19437 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ms4a1P19437 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ms4a1P19437 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ms4a1P19437 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ms4a1P19437 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ms4a1P19437 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ms4a1P19437 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ms4a1P19437 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ms4a1P19437 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ms4a1P19437 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ms4a1P19437 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ms4a1P19437 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Ms4a1P19437 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ms4a1P19437 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ms4a1P19437 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ms4a1P19437 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ms4a1P19437 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ms4a1P19437 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ms4a1P19437 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ms4a1P19437 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ms4a1P19437 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ms4a1P19437 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ms4a1P19437 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ms4a1P19437 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ms4a1P19437 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ms4a1P19437 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ms4a1P19437 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Ms4a1P19437 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ms4a1P19437 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ms4a1P19437 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ms4a1P19437 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms