Protein–RNA interactions for Protein: P19182

Ifrd1, Interferon-related developmental regulator 1, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifrd1P19182 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ifrd1P19182 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ifrd1P19182 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ifrd1P19182 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ifrd1P19182 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ifrd1P19182 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ifrd1P19182 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ifrd1P19182 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Ifrd1P19182 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ifrd1P19182 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ifrd1P19182 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ifrd1P19182 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ifrd1P19182 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ifrd1P19182 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ifrd1P19182 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ifrd1P19182 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ifrd1P19182 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ifrd1P19182 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ifrd1P19182 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ifrd1P19182 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Ifrd1P19182 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ifrd1P19182 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ifrd1P19182 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ifrd1P19182 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Ifrd1P19182 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Ifrd1P19182 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ifrd1P19182 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ifrd1P19182 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ifrd1P19182 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ifrd1P19182 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ifrd1P19182 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ifrd1P19182 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ifrd1P19182 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ifrd1P19182 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ifrd1P19182 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ifrd1P19182 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ifrd1P19182 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ifrd1P19182 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ifrd1P19182 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ifrd1P19182 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ifrd1P19182 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ifrd1P19182 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ifrd1P19182 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ifrd1P19182 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ifrd1P19182 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ifrd1P19182 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ifrd1P19182 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ifrd1P19182 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ifrd1P19182 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ifrd1P19182 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ifrd1P19182 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ifrd1P19182 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ifrd1P19182 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ifrd1P19182 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ifrd1P19182 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Ifrd1P19182 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ifrd1P19182 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ifrd1P19182 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ifrd1P19182 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ifrd1P19182 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ifrd1P19182 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ifrd1P19182 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ifrd1P19182 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ifrd1P19182 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ifrd1P19182 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ifrd1P19182 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ifrd1P19182 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ifrd1P19182 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ifrd1P19182 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ifrd1P19182 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Ifrd1P19182 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ifrd1P19182 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ifrd1P19182 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ifrd1P19182 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ifrd1P19182 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ifrd1P19182 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ifrd1P19182 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Ifrd1P19182 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ifrd1P19182 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ifrd1P19182 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ifrd1P19182 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ifrd1P19182 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ifrd1P19182 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ifrd1P19182 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ifrd1P19182 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ifrd1P19182 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ifrd1P19182 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ifrd1P19182 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ifrd1P19182 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ifrd1P19182 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ifrd1P19182 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ifrd1P19182 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Ifrd1P19182 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ifrd1P19182 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ifrd1P19182 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ifrd1P19182 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ifrd1P19182 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ifrd1P19182 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ifrd1P19182 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ifrd1P19182 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms