Protein–RNA interactions for Protein: P16381

D1Pas1, Putative ATP-dependent RNA helicase Pl10, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D1Pas1P16381 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
D1Pas1P16381 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
D1Pas1P16381 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
D1Pas1P16381 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
D1Pas1P16381 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
D1Pas1P16381 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
D1Pas1P16381 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
D1Pas1P16381 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
D1Pas1P16381 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
D1Pas1P16381 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
D1Pas1P16381 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
D1Pas1P16381 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
D1Pas1P16381 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
D1Pas1P16381 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
D1Pas1P16381 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
D1Pas1P16381 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
D1Pas1P16381 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
D1Pas1P16381 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
D1Pas1P16381 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
D1Pas1P16381 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
D1Pas1P16381 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
D1Pas1P16381 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
D1Pas1P16381 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
D1Pas1P16381 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
D1Pas1P16381 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
D1Pas1P16381 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
D1Pas1P16381 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
D1Pas1P16381 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
D1Pas1P16381 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
D1Pas1P16381 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
D1Pas1P16381 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
D1Pas1P16381 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
D1Pas1P16381 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
D1Pas1P16381 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
D1Pas1P16381 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
D1Pas1P16381 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
D1Pas1P16381 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
D1Pas1P16381 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
D1Pas1P16381 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
D1Pas1P16381 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
D1Pas1P16381 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
D1Pas1P16381 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
D1Pas1P16381 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
D1Pas1P16381 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
D1Pas1P16381 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
D1Pas1P16381 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
D1Pas1P16381 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
D1Pas1P16381 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
D1Pas1P16381 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
D1Pas1P16381 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
D1Pas1P16381 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
D1Pas1P16381 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
D1Pas1P16381 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
D1Pas1P16381 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
D1Pas1P16381 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
D1Pas1P16381 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
D1Pas1P16381 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
D1Pas1P16381 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
D1Pas1P16381 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
D1Pas1P16381 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
D1Pas1P16381 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
D1Pas1P16381 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
D1Pas1P16381 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
D1Pas1P16381 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
D1Pas1P16381 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
D1Pas1P16381 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
D1Pas1P16381 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
D1Pas1P16381 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
D1Pas1P16381 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
D1Pas1P16381 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
D1Pas1P16381 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
D1Pas1P16381 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
D1Pas1P16381 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
D1Pas1P16381 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
D1Pas1P16381 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
D1Pas1P16381 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
D1Pas1P16381 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
D1Pas1P16381 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
D1Pas1P16381 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
D1Pas1P16381 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
D1Pas1P16381 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
D1Pas1P16381 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
D1Pas1P16381 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
D1Pas1P16381 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
D1Pas1P16381 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
D1Pas1P16381 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
D1Pas1P16381 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
D1Pas1P16381 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
D1Pas1P16381 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
D1Pas1P16381 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
D1Pas1P16381 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
D1Pas1P16381 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
D1Pas1P16381 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
D1Pas1P16381 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
D1Pas1P16381 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
D1Pas1P16381 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
D1Pas1P16381 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
D1Pas1P16381 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
D1Pas1P16381 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
D1Pas1P16381 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms