Protein–RNA interactions for Protein: P15261

Ifngr1, Interferon gamma receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 477 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifngr1P15261 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ifngr1P15261 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ifngr1P15261 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ifngr1P15261 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ifngr1P15261 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ifngr1P15261 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ifngr1P15261 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ifngr1P15261 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ifngr1P15261 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ifngr1P15261 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ifngr1P15261 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ifngr1P15261 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ifngr1P15261 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ifngr1P15261 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ifngr1P15261 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ifngr1P15261 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ifngr1P15261 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ifngr1P15261 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ifngr1P15261 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ifngr1P15261 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ifngr1P15261 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ifngr1P15261 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ifngr1P15261 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ifngr1P15261 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ifngr1P15261 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ifngr1P15261 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ifngr1P15261 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ifngr1P15261 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ifngr1P15261 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ifngr1P15261 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ifngr1P15261 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ifngr1P15261 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ifngr1P15261 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Ifngr1P15261 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ifngr1P15261 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ifngr1P15261 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ifngr1P15261 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ifngr1P15261 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ifngr1P15261 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ifngr1P15261 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Ifngr1P15261 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ifngr1P15261 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ifngr1P15261 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ifngr1P15261 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ifngr1P15261 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ifngr1P15261 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ifngr1P15261 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ifngr1P15261 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Ifngr1P15261 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ifngr1P15261 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Ifngr1P15261 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ifngr1P15261 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ifngr1P15261 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ifngr1P15261 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ifngr1P15261 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ifngr1P15261 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ifngr1P15261 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ifngr1P15261 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ifngr1P15261 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Ifngr1P15261 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ifngr1P15261 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Ifngr1P15261 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ifngr1P15261 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ifngr1P15261 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Ifngr1P15261 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ifngr1P15261 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ifngr1P15261 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ifngr1P15261 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ifngr1P15261 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ifngr1P15261 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ifngr1P15261 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ifngr1P15261 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ifngr1P15261 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Ifngr1P15261 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ifngr1P15261 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ifngr1P15261 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ifngr1P15261 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ifngr1P15261 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ifngr1P15261 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ifngr1P15261 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Ifngr1P15261 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ifngr1P15261 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Ifngr1P15261 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ifngr1P15261 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Ifngr1P15261 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ifngr1P15261 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ifngr1P15261 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ifngr1P15261 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ifngr1P15261 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ifngr1P15261 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ifngr1P15261 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ifngr1P15261 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ifngr1P15261 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ifngr1P15261 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ifngr1P15261 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ifngr1P15261 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ifngr1P15261 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ifngr1P15261 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ifngr1P15261 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ifngr1P15261 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms