Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Vpreb1P13372 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Vpreb1P13372 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Vpreb1P13372 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Vpreb1P13372 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Vpreb1P13372 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Vpreb1P13372 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Vpreb1P13372 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Vpreb1P13372 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Vpreb1P13372 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Vpreb1P13372 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Vpreb1P13372 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Vpreb1P13372 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Vpreb1P13372 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Vpreb1P13372 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Vpreb1P13372 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Vpreb1P13372 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Vpreb1P13372 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Vpreb1P13372 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Vpreb1P13372 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Vpreb1P13372 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Vpreb1P13372 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Vpreb1P13372 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Vpreb1P13372 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Vpreb1P13372 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Vpreb1P13372 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Vpreb1P13372 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Vpreb1P13372 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Vpreb1P13372 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Vpreb1P13372 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Vpreb1P13372 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Vpreb1P13372 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Vpreb1P13372 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Vpreb1P13372 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Vpreb1P13372 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Vpreb1P13372 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Vpreb1P13372 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Vpreb1P13372 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Vpreb1P13372 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Vpreb1P13372 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Vpreb1P13372 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Vpreb1P13372 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Vpreb1P13372 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Vpreb1P13372 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Vpreb1P13372 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Vpreb1P13372 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Vpreb1P13372 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Vpreb1P13372 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Vpreb1P13372 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Vpreb1P13372 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Vpreb1P13372 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Vpreb1P13372 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Vpreb1P13372 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Vpreb1P13372 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Vpreb1P13372 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Vpreb1P13372 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Vpreb1P13372 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Vpreb1P13372 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Vpreb1P13372 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Vpreb1P13372 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Vpreb1P13372 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Vpreb1P13372 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Vpreb1P13372 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Vpreb1P13372 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Vpreb1P13372 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Vpreb1P13372 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Vpreb1P13372 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Vpreb1P13372 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Vpreb1P13372 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Vpreb1P13372 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Vpreb1P13372 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Vpreb1P13372 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Vpreb1P13372 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Vpreb1P13372 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Vpreb1P13372 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Vpreb1P13372 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Vpreb1P13372 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Vpreb1P13372 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Vpreb1P13372 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Vpreb1P13372 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Vpreb1P13372 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Vpreb1P13372 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Vpreb1P13372 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Vpreb1P13372 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Vpreb1P13372 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Vpreb1P13372 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Vpreb1P13372 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Vpreb1P13372 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Vpreb1P13372 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Vpreb1P13372 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Vpreb1P13372 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Vpreb1P13372 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Vpreb1P13372 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Vpreb1P13372 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Vpreb1P13372 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Vpreb1P13372 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Vpreb1P13372 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Vpreb1P13372 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Vpreb1P13372 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Vpreb1P13372 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.7 ms