Protein–RNA interactions for Protein: P0C7T6

Atxn1l, Ataxin-1-like, mousemouse

Predictions only

Length 687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn1lP0C7T6 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atxn1lP0C7T6 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atxn1lP0C7T6 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atxn1lP0C7T6 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atxn1lP0C7T6 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atxn1lP0C7T6 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atxn1lP0C7T6 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atxn1lP0C7T6 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atxn1lP0C7T6 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atxn1lP0C7T6 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atxn1lP0C7T6 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atxn1lP0C7T6 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atxn1lP0C7T6 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atxn1lP0C7T6 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atxn1lP0C7T6 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atxn1lP0C7T6 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atxn1lP0C7T6 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atxn1lP0C7T6 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atxn1lP0C7T6 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atxn1lP0C7T6 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atxn1lP0C7T6 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atxn1lP0C7T6 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atxn1lP0C7T6 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atxn1lP0C7T6 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atxn1lP0C7T6 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atxn1lP0C7T6 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atxn1lP0C7T6 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atxn1lP0C7T6 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Atxn1lP0C7T6 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Atxn1lP0C7T6 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Atxn1lP0C7T6 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Atxn1lP0C7T6 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Atxn1lP0C7T6 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atxn1lP0C7T6 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atxn1lP0C7T6 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atxn1lP0C7T6 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Atxn1lP0C7T6 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atxn1lP0C7T6 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atxn1lP0C7T6 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atxn1lP0C7T6 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atxn1lP0C7T6 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Atxn1lP0C7T6 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atxn1lP0C7T6 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atxn1lP0C7T6 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atxn1lP0C7T6 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atxn1lP0C7T6 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atxn1lP0C7T6 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atxn1lP0C7T6 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atxn1lP0C7T6 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atxn1lP0C7T6 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atxn1lP0C7T6 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atxn1lP0C7T6 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atxn1lP0C7T6 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atxn1lP0C7T6 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atxn1lP0C7T6 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atxn1lP0C7T6 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atxn1lP0C7T6 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atxn1lP0C7T6 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atxn1lP0C7T6 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atxn1lP0C7T6 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Atxn1lP0C7T6 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atxn1lP0C7T6 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atxn1lP0C7T6 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atxn1lP0C7T6 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atxn1lP0C7T6 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atxn1lP0C7T6 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atxn1lP0C7T6 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atxn1lP0C7T6 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atxn1lP0C7T6 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atxn1lP0C7T6 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Atxn1lP0C7T6 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atxn1lP0C7T6 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atxn1lP0C7T6 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atxn1lP0C7T6 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atxn1lP0C7T6 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atxn1lP0C7T6 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atxn1lP0C7T6 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atxn1lP0C7T6 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atxn1lP0C7T6 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atxn1lP0C7T6 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atxn1lP0C7T6 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atxn1lP0C7T6 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atxn1lP0C7T6 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atxn1lP0C7T6 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atxn1lP0C7T6 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atxn1lP0C7T6 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atxn1lP0C7T6 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atxn1lP0C7T6 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atxn1lP0C7T6 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atxn1lP0C7T6 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atxn1lP0C7T6 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atxn1lP0C7T6 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atxn1lP0C7T6 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Atxn1lP0C7T6 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atxn1lP0C7T6 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atxn1lP0C7T6 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atxn1lP0C7T6 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atxn1lP0C7T6 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Atxn1lP0C7T6 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atxn1lP0C7T6 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms