Protein–RNA interactions for Protein: P04213

T-cell receptor beta chain V region C5 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04213 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
P04213 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
P04213 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
P04213 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
P04213 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
P04213 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
P04213 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
P04213 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
P04213 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.28■■□□□ 1
P04213 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
P04213 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
P04213 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
P04213 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
P04213 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
P04213 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
P04213 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
P04213 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
P04213 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
P04213 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
P04213 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
P04213 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
P04213 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
P04213 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
P04213 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
P04213 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
P04213 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
P04213 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
P04213 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
P04213 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
P04213 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
P04213 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
P04213 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
P04213 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
P04213 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
P04213 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
P04213 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
P04213 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
P04213 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
P04213 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
P04213 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
P04213 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
P04213 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
P04213 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
P04213 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
P04213 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
P04213 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
P04213 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
P04213 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
P04213 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
P04213 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
P04213 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
P04213 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
P04213 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
P04213 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
P04213 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
P04213 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
P04213 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
P04213 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
P04213 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
P04213 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
P04213 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
P04213 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
P04213 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
P04213 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
P04213 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
P04213 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
P04213 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
P04213 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
P04213 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
P04213 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
P04213 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
P04213 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
P04213 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
P04213 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
P04213 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
P04213 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
P04213 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
P04213 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
P04213 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
P04213 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
P04213 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
P04213 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
P04213 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
P04213 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
P04213 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
P04213 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
P04213 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
P04213 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
P04213 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
P04213 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
P04213 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
P04213 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
P04213 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
P04213 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
P04213 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
P04213 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
P04213 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
P04213 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
P04213 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
P04213 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 146.5 ms