Protein–RNA interactions for Protein: P01738

T-cell receptor alpha chain V region PHDS58, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01738 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01738 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01738 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01738 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01738 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01738 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01738 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01738 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01738 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01738 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01738 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01738 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
P01738 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01738 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01738 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01738 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01738 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01738 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01738 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01738 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01738 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01738 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01738 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
P01738 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01738 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01738 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01738 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01738 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01738 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01738 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01738 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01738 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01738 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01738 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01738 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01738 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01738 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01738 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01738 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01738 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01738 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01738 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01738 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01738 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01738 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01738 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01738 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01738 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01738 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01738 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01738 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01738 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01738 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01738 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01738 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01738 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01738 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01738 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01738 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01738 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01738 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01738 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01738 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01738 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01738 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01738 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01738 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01738 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01738 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01738 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01738 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01738 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01738 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01738 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01738 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01738 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01738 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01738 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
P01738 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01738 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
P01738 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01738 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
P01738 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01738 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01738 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01738 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01738 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
P01738 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01738 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01738 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01738 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01738 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01738 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01738 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01738 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01738 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01738 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01738 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01738 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
P01738 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 153 ms