Protein–RNA interactions for Protein: O70491

Stra6, Receptor for retinol uptake STRA6, mousemouse

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stra6O70491 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Stra6O70491 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Stra6O70491 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Stra6O70491 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Stra6O70491 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Stra6O70491 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Stra6O70491 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Stra6O70491 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Stra6O70491 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Stra6O70491 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Stra6O70491 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Stra6O70491 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Stra6O70491 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Stra6O70491 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Stra6O70491 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Stra6O70491 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Stra6O70491 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Stra6O70491 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Stra6O70491 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Stra6O70491 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Stra6O70491 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Stra6O70491 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Stra6O70491 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Stra6O70491 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Stra6O70491 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Stra6O70491 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Stra6O70491 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Stra6O70491 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Stra6O70491 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Stra6O70491 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Stra6O70491 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Stra6O70491 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Stra6O70491 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Stra6O70491 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Stra6O70491 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Stra6O70491 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Stra6O70491 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Stra6O70491 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Stra6O70491 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Stra6O70491 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Stra6O70491 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Stra6O70491 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Stra6O70491 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Stra6O70491 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Stra6O70491 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Stra6O70491 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Stra6O70491 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Stra6O70491 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Stra6O70491 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Stra6O70491 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Stra6O70491 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Stra6O70491 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Stra6O70491 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Stra6O70491 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Stra6O70491 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Stra6O70491 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Stra6O70491 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Stra6O70491 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Stra6O70491 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Stra6O70491 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Stra6O70491 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Stra6O70491 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Stra6O70491 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Stra6O70491 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Stra6O70491 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Stra6O70491 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Stra6O70491 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Stra6O70491 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Stra6O70491 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Stra6O70491 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Stra6O70491 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Stra6O70491 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Stra6O70491 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Stra6O70491 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Stra6O70491 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Stra6O70491 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Stra6O70491 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Stra6O70491 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Stra6O70491 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Stra6O70491 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Stra6O70491 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Stra6O70491 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Stra6O70491 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Stra6O70491 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Stra6O70491 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Stra6O70491 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Stra6O70491 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Stra6O70491 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Stra6O70491 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Stra6O70491 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Stra6O70491 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Stra6O70491 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Stra6O70491 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Stra6O70491 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Stra6O70491 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Stra6O70491 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Stra6O70491 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Stra6O70491 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Stra6O70491 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Stra6O70491 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.6 ms