Protein–RNA interactions for Protein: O35955

Psmb10, Proteasome subunit beta type-10, mousemouse

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb10O35955 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Psmb10O35955 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Psmb10O35955 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Psmb10O35955 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Psmb10O35955 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Psmb10O35955 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Psmb10O35955 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Psmb10O35955 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Psmb10O35955 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Psmb10O35955 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Psmb10O35955 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Psmb10O35955 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Psmb10O35955 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Psmb10O35955 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Psmb10O35955 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Psmb10O35955 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Psmb10O35955 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Psmb10O35955 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Psmb10O35955 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Psmb10O35955 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Psmb10O35955 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Psmb10O35955 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Psmb10O35955 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Psmb10O35955 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Psmb10O35955 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Psmb10O35955 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Psmb10O35955 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Psmb10O35955 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Psmb10O35955 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Psmb10O35955 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Psmb10O35955 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Psmb10O35955 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Psmb10O35955 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Psmb10O35955 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Psmb10O35955 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Psmb10O35955 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Psmb10O35955 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Psmb10O35955 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Psmb10O35955 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Psmb10O35955 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Psmb10O35955 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Psmb10O35955 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Psmb10O35955 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Psmb10O35955 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Psmb10O35955 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Psmb10O35955 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Psmb10O35955 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Psmb10O35955 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Psmb10O35955 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Psmb10O35955 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Psmb10O35955 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Psmb10O35955 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Psmb10O35955 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Psmb10O35955 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Psmb10O35955 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Psmb10O35955 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Psmb10O35955 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Psmb10O35955 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Psmb10O35955 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Psmb10O35955 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Psmb10O35955 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Psmb10O35955 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Psmb10O35955 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Psmb10O35955 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Psmb10O35955 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Psmb10O35955 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Psmb10O35955 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Psmb10O35955 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Psmb10O35955 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Psmb10O35955 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Psmb10O35955 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Psmb10O35955 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Psmb10O35955 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Psmb10O35955 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Psmb10O35955 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Psmb10O35955 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Psmb10O35955 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Psmb10O35955 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Psmb10O35955 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Psmb10O35955 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Psmb10O35955 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Psmb10O35955 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Psmb10O35955 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Psmb10O35955 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Psmb10O35955 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Psmb10O35955 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Psmb10O35955 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Psmb10O35955 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Psmb10O35955 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Psmb10O35955 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Psmb10O35955 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Psmb10O35955 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Psmb10O35955 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Psmb10O35955 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Psmb10O35955 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Psmb10O35955 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Psmb10O35955 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Psmb10O35955 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Psmb10O35955 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Psmb10O35955 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms