Protein–RNA interactions for Protein: O35942

Nek2, Serine/threonine-protein kinase Nek2, mousemouse

Predictions only

Length 443 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek2O35942 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nek2O35942 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nek2O35942 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nek2O35942 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nek2O35942 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nek2O35942 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nek2O35942 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Nek2O35942 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nek2O35942 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nek2O35942 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Nek2O35942 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Nek2O35942 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Nek2O35942 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nek2O35942 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nek2O35942 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Nek2O35942 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nek2O35942 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nek2O35942 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nek2O35942 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nek2O35942 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nek2O35942 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nek2O35942 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nek2O35942 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nek2O35942 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nek2O35942 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nek2O35942 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nek2O35942 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nek2O35942 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nek2O35942 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nek2O35942 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nek2O35942 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Nek2O35942 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nek2O35942 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nek2O35942 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nek2O35942 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nek2O35942 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nek2O35942 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nek2O35942 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nek2O35942 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nek2O35942 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nek2O35942 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nek2O35942 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nek2O35942 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nek2O35942 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nek2O35942 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nek2O35942 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nek2O35942 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nek2O35942 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nek2O35942 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nek2O35942 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nek2O35942 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Nek2O35942 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nek2O35942 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nek2O35942 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nek2O35942 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nek2O35942 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nek2O35942 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nek2O35942 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nek2O35942 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nek2O35942 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nek2O35942 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nek2O35942 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nek2O35942 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nek2O35942 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nek2O35942 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nek2O35942 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nek2O35942 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Nek2O35942 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nek2O35942 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nek2O35942 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nek2O35942 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nek2O35942 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nek2O35942 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nek2O35942 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nek2O35942 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nek2O35942 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Nek2O35942 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nek2O35942 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nek2O35942 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nek2O35942 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nek2O35942 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nek2O35942 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nek2O35942 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nek2O35942 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nek2O35942 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nek2O35942 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nek2O35942 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nek2O35942 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nek2O35942 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nek2O35942 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nek2O35942 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nek2O35942 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nek2O35942 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nek2O35942 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nek2O35942 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nek2O35942 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nek2O35942 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nek2O35942 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nek2O35942 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nek2O35942 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms