Protein–RNA interactions for Protein: O35902

Dsg3, Desmoglein-3, mousemouse

Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg3O35902 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Dsg3O35902 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Dsg3O35902 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Dsg3O35902 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Dsg3O35902 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Dsg3O35902 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Dsg3O35902 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Dsg3O35902 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Dsg3O35902 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Dsg3O35902 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Dsg3O35902 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Dsg3O35902 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Dsg3O35902 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Dsg3O35902 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Dsg3O35902 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Dsg3O35902 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Dsg3O35902 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Dsg3O35902 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Dsg3O35902 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Dsg3O35902 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Dsg3O35902 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Dsg3O35902 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Dsg3O35902 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Dsg3O35902 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Dsg3O35902 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Dsg3O35902 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Dsg3O35902 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Dsg3O35902 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Dsg3O35902 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Dsg3O35902 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Dsg3O35902 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Dsg3O35902 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Dsg3O35902 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Dsg3O35902 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Dsg3O35902 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Dsg3O35902 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Dsg3O35902 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Dsg3O35902 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Dsg3O35902 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Dsg3O35902 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Dsg3O35902 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Dsg3O35902 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Dsg3O35902 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Dsg3O35902 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Dsg3O35902 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Dsg3O35902 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Dsg3O35902 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Dsg3O35902 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Dsg3O35902 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Dsg3O35902 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Dsg3O35902 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Dsg3O35902 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Dsg3O35902 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Dsg3O35902 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Dsg3O35902 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Dsg3O35902 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Dsg3O35902 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Dsg3O35902 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Dsg3O35902 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Dsg3O35902 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Dsg3O35902 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Dsg3O35902 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Dsg3O35902 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Dsg3O35902 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Dsg3O35902 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Dsg3O35902 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Dsg3O35902 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Dsg3O35902 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Dsg3O35902 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Dsg3O35902 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Dsg3O35902 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Dsg3O35902 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Dsg3O35902 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Dsg3O35902 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Dsg3O35902 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Dsg3O35902 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Dsg3O35902 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Dsg3O35902 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Dsg3O35902 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Dsg3O35902 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Dsg3O35902 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Dsg3O35902 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Dsg3O35902 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Dsg3O35902 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Dsg3O35902 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Dsg3O35902 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Dsg3O35902 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Dsg3O35902 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Dsg3O35902 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Dsg3O35902 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Dsg3O35902 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Dsg3O35902 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Dsg3O35902 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Dsg3O35902 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Dsg3O35902 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Dsg3O35902 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Dsg3O35902 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Dsg3O35902 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Dsg3O35902 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Dsg3O35902 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms