Protein–RNA interactions for Protein: O35177

Nedd9, Enhancer of filamentation 1, mousemouse

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd9O35177 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nedd9O35177 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Nedd9O35177 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nedd9O35177 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nedd9O35177 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nedd9O35177 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nedd9O35177 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nedd9O35177 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nedd9O35177 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nedd9O35177 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nedd9O35177 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nedd9O35177 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nedd9O35177 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nedd9O35177 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nedd9O35177 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nedd9O35177 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nedd9O35177 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nedd9O35177 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nedd9O35177 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nedd9O35177 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nedd9O35177 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nedd9O35177 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nedd9O35177 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nedd9O35177 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nedd9O35177 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nedd9O35177 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nedd9O35177 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nedd9O35177 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nedd9O35177 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nedd9O35177 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nedd9O35177 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nedd9O35177 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nedd9O35177 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nedd9O35177 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nedd9O35177 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nedd9O35177 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nedd9O35177 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nedd9O35177 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nedd9O35177 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nedd9O35177 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nedd9O35177 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nedd9O35177 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nedd9O35177 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nedd9O35177 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nedd9O35177 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nedd9O35177 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nedd9O35177 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nedd9O35177 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nedd9O35177 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nedd9O35177 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nedd9O35177 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nedd9O35177 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nedd9O35177 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nedd9O35177 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nedd9O35177 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Nedd9O35177 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Nedd9O35177 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nedd9O35177 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nedd9O35177 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Nedd9O35177 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nedd9O35177 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nedd9O35177 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nedd9O35177 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nedd9O35177 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nedd9O35177 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nedd9O35177 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Nedd9O35177 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nedd9O35177 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nedd9O35177 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nedd9O35177 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nedd9O35177 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nedd9O35177 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nedd9O35177 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nedd9O35177 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nedd9O35177 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nedd9O35177 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Nedd9O35177 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nedd9O35177 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Nedd9O35177 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nedd9O35177 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nedd9O35177 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nedd9O35177 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nedd9O35177 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nedd9O35177 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nedd9O35177 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nedd9O35177 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nedd9O35177 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nedd9O35177 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nedd9O35177 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nedd9O35177 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nedd9O35177 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nedd9O35177 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nedd9O35177 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nedd9O35177 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nedd9O35177 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nedd9O35177 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nedd9O35177 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nedd9O35177 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nedd9O35177 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nedd9O35177 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
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