Protein–RNA interactions for Protein: O08999

Ltbp2, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,813 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ltbp2O08999 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Ltbp2O08999 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ltbp2O08999 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ltbp2O08999 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ltbp2O08999 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ltbp2O08999 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ltbp2O08999 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ltbp2O08999 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ltbp2O08999 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ltbp2O08999 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ltbp2O08999 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ltbp2O08999 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ltbp2O08999 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ltbp2O08999 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ltbp2O08999 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ltbp2O08999 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Ltbp2O08999 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ltbp2O08999 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ltbp2O08999 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ltbp2O08999 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ltbp2O08999 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ltbp2O08999 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ltbp2O08999 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ltbp2O08999 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ltbp2O08999 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ltbp2O08999 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ltbp2O08999 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ltbp2O08999 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ltbp2O08999 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ltbp2O08999 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ltbp2O08999 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ltbp2O08999 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ltbp2O08999 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ltbp2O08999 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ltbp2O08999 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ltbp2O08999 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ltbp2O08999 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ltbp2O08999 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ltbp2O08999 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ltbp2O08999 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ltbp2O08999 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Ltbp2O08999 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ltbp2O08999 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ltbp2O08999 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Ltbp2O08999 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ltbp2O08999 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ltbp2O08999 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ltbp2O08999 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Ltbp2O08999 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ltbp2O08999 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ltbp2O08999 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ltbp2O08999 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ltbp2O08999 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ltbp2O08999 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ltbp2O08999 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ltbp2O08999 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Ltbp2O08999 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ltbp2O08999 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ltbp2O08999 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ltbp2O08999 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Ltbp2O08999 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Ltbp2O08999 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ltbp2O08999 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ltbp2O08999 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ltbp2O08999 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ltbp2O08999 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ltbp2O08999 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ltbp2O08999 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ltbp2O08999 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ltbp2O08999 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ltbp2O08999 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ltbp2O08999 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ltbp2O08999 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ltbp2O08999 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ltbp2O08999 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ltbp2O08999 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ltbp2O08999 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ltbp2O08999 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ltbp2O08999 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ltbp2O08999 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ltbp2O08999 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ltbp2O08999 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ltbp2O08999 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ltbp2O08999 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ltbp2O08999 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ltbp2O08999 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Ltbp2O08999 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ltbp2O08999 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ltbp2O08999 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ltbp2O08999 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ltbp2O08999 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ltbp2O08999 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ltbp2O08999 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ltbp2O08999 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ltbp2O08999 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ltbp2O08999 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ltbp2O08999 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ltbp2O08999 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ltbp2O08999 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ltbp2O08999 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms