Protein–RNA interactions for Protein: G3X9K3

Arfgef1, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,846 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfgef1G3X9K3 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Arfgef1G3X9K3 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Arfgef1G3X9K3 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Arfgef1G3X9K3 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Arfgef1G3X9K3 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Arfgef1G3X9K3 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Arfgef1G3X9K3 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Arfgef1G3X9K3 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Arfgef1G3X9K3 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Arfgef1G3X9K3 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Arfgef1G3X9K3 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Arfgef1G3X9K3 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Arfgef1G3X9K3 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Arfgef1G3X9K3 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Arfgef1G3X9K3 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Arfgef1G3X9K3 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Arfgef1G3X9K3 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Arfgef1G3X9K3 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Arfgef1G3X9K3 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Arfgef1G3X9K3 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Arfgef1G3X9K3 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Arfgef1G3X9K3 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Arfgef1G3X9K3 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Arfgef1G3X9K3 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Arfgef1G3X9K3 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Arfgef1G3X9K3 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Arfgef1G3X9K3 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Arfgef1G3X9K3 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Arfgef1G3X9K3 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Arfgef1G3X9K3 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Arfgef1G3X9K3 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Arfgef1G3X9K3 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Arfgef1G3X9K3 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Arfgef1G3X9K3 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Arfgef1G3X9K3 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Arfgef1G3X9K3 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Arfgef1G3X9K3 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Arfgef1G3X9K3 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Arfgef1G3X9K3 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Arfgef1G3X9K3 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Arfgef1G3X9K3 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Arfgef1G3X9K3 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Arfgef1G3X9K3 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Arfgef1G3X9K3 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Arfgef1G3X9K3 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Arfgef1G3X9K3 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Arfgef1G3X9K3 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Arfgef1G3X9K3 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Arfgef1G3X9K3 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Arfgef1G3X9K3 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Arfgef1G3X9K3 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Arfgef1G3X9K3 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Arfgef1G3X9K3 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Arfgef1G3X9K3 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Arfgef1G3X9K3 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Arfgef1G3X9K3 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Arfgef1G3X9K3 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Arfgef1G3X9K3 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Arfgef1G3X9K3 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Arfgef1G3X9K3 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Arfgef1G3X9K3 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Arfgef1G3X9K3 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Arfgef1G3X9K3 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Arfgef1G3X9K3 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Arfgef1G3X9K3 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Arfgef1G3X9K3 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Arfgef1G3X9K3 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Arfgef1G3X9K3 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Arfgef1G3X9K3 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Arfgef1G3X9K3 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Arfgef1G3X9K3 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Arfgef1G3X9K3 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Arfgef1G3X9K3 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Arfgef1G3X9K3 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Arfgef1G3X9K3 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Arfgef1G3X9K3 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Arfgef1G3X9K3 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Arfgef1G3X9K3 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Arfgef1G3X9K3 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Arfgef1G3X9K3 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Arfgef1G3X9K3 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Arfgef1G3X9K3 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Arfgef1G3X9K3 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Arfgef1G3X9K3 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Arfgef1G3X9K3 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Arfgef1G3X9K3 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Arfgef1G3X9K3 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Arfgef1G3X9K3 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Arfgef1G3X9K3 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Arfgef1G3X9K3 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Arfgef1G3X9K3 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Arfgef1G3X9K3 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Arfgef1G3X9K3 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Arfgef1G3X9K3 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Arfgef1G3X9K3 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Arfgef1G3X9K3 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Arfgef1G3X9K3 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Arfgef1G3X9K3 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Arfgef1G3X9K3 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Arfgef1G3X9K3 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms