Protein–RNA interactions for Protein: F6YCR7

Rhox13, Homeobox protein Rhox13, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox13F6YCR7 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Rhox13F6YCR7 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rhox13F6YCR7 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rhox13F6YCR7 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Rhox13F6YCR7 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rhox13F6YCR7 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rhox13F6YCR7 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rhox13F6YCR7 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rhox13F6YCR7 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rhox13F6YCR7 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rhox13F6YCR7 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rhox13F6YCR7 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rhox13F6YCR7 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rhox13F6YCR7 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rhox13F6YCR7 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rhox13F6YCR7 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rhox13F6YCR7 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rhox13F6YCR7 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rhox13F6YCR7 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rhox13F6YCR7 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rhox13F6YCR7 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rhox13F6YCR7 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rhox13F6YCR7 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rhox13F6YCR7 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rhox13F6YCR7 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rhox13F6YCR7 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rhox13F6YCR7 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rhox13F6YCR7 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rhox13F6YCR7 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rhox13F6YCR7 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rhox13F6YCR7 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rhox13F6YCR7 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rhox13F6YCR7 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rhox13F6YCR7 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Rhox13F6YCR7 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rhox13F6YCR7 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rhox13F6YCR7 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Rhox13F6YCR7 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rhox13F6YCR7 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rhox13F6YCR7 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rhox13F6YCR7 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rhox13F6YCR7 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rhox13F6YCR7 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rhox13F6YCR7 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rhox13F6YCR7 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rhox13F6YCR7 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rhox13F6YCR7 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rhox13F6YCR7 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rhox13F6YCR7 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rhox13F6YCR7 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Rhox13F6YCR7 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Rhox13F6YCR7 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rhox13F6YCR7 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rhox13F6YCR7 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rhox13F6YCR7 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rhox13F6YCR7 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rhox13F6YCR7 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rhox13F6YCR7 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rhox13F6YCR7 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rhox13F6YCR7 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rhox13F6YCR7 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rhox13F6YCR7 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rhox13F6YCR7 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rhox13F6YCR7 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rhox13F6YCR7 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Rhox13F6YCR7 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rhox13F6YCR7 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rhox13F6YCR7 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rhox13F6YCR7 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rhox13F6YCR7 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rhox13F6YCR7 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rhox13F6YCR7 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rhox13F6YCR7 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rhox13F6YCR7 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rhox13F6YCR7 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rhox13F6YCR7 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rhox13F6YCR7 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rhox13F6YCR7 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rhox13F6YCR7 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rhox13F6YCR7 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rhox13F6YCR7 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rhox13F6YCR7 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rhox13F6YCR7 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rhox13F6YCR7 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rhox13F6YCR7 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rhox13F6YCR7 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rhox13F6YCR7 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rhox13F6YCR7 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rhox13F6YCR7 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rhox13F6YCR7 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rhox13F6YCR7 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rhox13F6YCR7 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rhox13F6YCR7 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rhox13F6YCR7 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rhox13F6YCR7 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rhox13F6YCR7 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rhox13F6YCR7 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rhox13F6YCR7 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rhox13F6YCR7 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rhox13F6YCR7 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms