Protein–RNA interactions for Protein: F6XS56

Gm8444, Predicted gene 8444, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8444F6XS56 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm8444F6XS56 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm8444F6XS56 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm8444F6XS56 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm8444F6XS56 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm8444F6XS56 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm8444F6XS56 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm8444F6XS56 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm8444F6XS56 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm8444F6XS56 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm8444F6XS56 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm8444F6XS56 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm8444F6XS56 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm8444F6XS56 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm8444F6XS56 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm8444F6XS56 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm8444F6XS56 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm8444F6XS56 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gm8444F6XS56 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gm8444F6XS56 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Gm8444F6XS56 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gm8444F6XS56 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gm8444F6XS56 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gm8444F6XS56 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm8444F6XS56 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm8444F6XS56 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm8444F6XS56 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm8444F6XS56 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm8444F6XS56 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm8444F6XS56 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm8444F6XS56 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm8444F6XS56 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm8444F6XS56 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm8444F6XS56 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm8444F6XS56 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm8444F6XS56 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm8444F6XS56 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm8444F6XS56 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm8444F6XS56 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm8444F6XS56 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm8444F6XS56 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm8444F6XS56 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm8444F6XS56 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm8444F6XS56 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm8444F6XS56 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm8444F6XS56 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm8444F6XS56 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm8444F6XS56 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm8444F6XS56 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm8444F6XS56 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm8444F6XS56 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm8444F6XS56 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm8444F6XS56 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm8444F6XS56 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm8444F6XS56 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm8444F6XS56 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm8444F6XS56 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm8444F6XS56 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm8444F6XS56 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm8444F6XS56 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm8444F6XS56 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm8444F6XS56 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm8444F6XS56 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm8444F6XS56 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm8444F6XS56 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm8444F6XS56 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm8444F6XS56 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm8444F6XS56 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm8444F6XS56 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm8444F6XS56 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm8444F6XS56 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm8444F6XS56 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm8444F6XS56 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm8444F6XS56 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm8444F6XS56 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm8444F6XS56 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm8444F6XS56 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm8444F6XS56 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm8444F6XS56 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm8444F6XS56 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm8444F6XS56 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm8444F6XS56 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm8444F6XS56 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm8444F6XS56 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm8444F6XS56 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm8444F6XS56 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm8444F6XS56 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm8444F6XS56 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm8444F6XS56 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm8444F6XS56 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm8444F6XS56 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm8444F6XS56 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm8444F6XS56 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Gm8444F6XS56 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm8444F6XS56 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm8444F6XS56 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm8444F6XS56 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm8444F6XS56 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm8444F6XS56 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm8444F6XS56 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.4 ms