Protein–RNA interactions for Protein: F6VRN1

Smgc, Submandibular gland protein C (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmgcF6VRN1 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SmgcF6VRN1 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SmgcF6VRN1 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SmgcF6VRN1 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SmgcF6VRN1 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SmgcF6VRN1 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SmgcF6VRN1 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SmgcF6VRN1 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SmgcF6VRN1 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SmgcF6VRN1 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SmgcF6VRN1 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SmgcF6VRN1 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SmgcF6VRN1 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SmgcF6VRN1 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SmgcF6VRN1 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SmgcF6VRN1 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SmgcF6VRN1 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SmgcF6VRN1 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
SmgcF6VRN1 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
SmgcF6VRN1 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
SmgcF6VRN1 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SmgcF6VRN1 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SmgcF6VRN1 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SmgcF6VRN1 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SmgcF6VRN1 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SmgcF6VRN1 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SmgcF6VRN1 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SmgcF6VRN1 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SmgcF6VRN1 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SmgcF6VRN1 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SmgcF6VRN1 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SmgcF6VRN1 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SmgcF6VRN1 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SmgcF6VRN1 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SmgcF6VRN1 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SmgcF6VRN1 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SmgcF6VRN1 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SmgcF6VRN1 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SmgcF6VRN1 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SmgcF6VRN1 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SmgcF6VRN1 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SmgcF6VRN1 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SmgcF6VRN1 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SmgcF6VRN1 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SmgcF6VRN1 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SmgcF6VRN1 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SmgcF6VRN1 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SmgcF6VRN1 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SmgcF6VRN1 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SmgcF6VRN1 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SmgcF6VRN1 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SmgcF6VRN1 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SmgcF6VRN1 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SmgcF6VRN1 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SmgcF6VRN1 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
SmgcF6VRN1 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SmgcF6VRN1 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SmgcF6VRN1 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SmgcF6VRN1 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SmgcF6VRN1 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SmgcF6VRN1 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SmgcF6VRN1 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SmgcF6VRN1 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SmgcF6VRN1 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SmgcF6VRN1 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SmgcF6VRN1 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SmgcF6VRN1 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SmgcF6VRN1 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SmgcF6VRN1 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SmgcF6VRN1 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SmgcF6VRN1 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SmgcF6VRN1 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SmgcF6VRN1 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SmgcF6VRN1 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SmgcF6VRN1 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SmgcF6VRN1 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SmgcF6VRN1 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SmgcF6VRN1 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SmgcF6VRN1 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SmgcF6VRN1 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SmgcF6VRN1 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SmgcF6VRN1 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SmgcF6VRN1 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SmgcF6VRN1 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SmgcF6VRN1 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SmgcF6VRN1 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SmgcF6VRN1 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SmgcF6VRN1 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SmgcF6VRN1 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SmgcF6VRN1 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SmgcF6VRN1 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SmgcF6VRN1 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SmgcF6VRN1 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SmgcF6VRN1 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SmgcF6VRN1 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SmgcF6VRN1 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SmgcF6VRN1 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SmgcF6VRN1 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SmgcF6VRN1 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SmgcF6VRN1 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms