Protein–RNA interactions for Protein: F6QRE9

Erich3, Glutamate-rich 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,637 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Erich3F6QRE9 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.15
Erich3F6QRE9 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Erich3F6QRE9 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Erich3F6QRE9 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC34.69■■■■□ 3.14
Erich3F6QRE9 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Erich3F6QRE9 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Erich3F6QRE9 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
Erich3F6QRE9 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
Erich3F6QRE9 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.68■■■■□ 3.14
Erich3F6QRE9 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
Erich3F6QRE9 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.67■■■■□ 3.14
Erich3F6QRE9 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Erich3F6QRE9 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Erich3F6QRE9 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC34.66■■■■□ 3.14
Erich3F6QRE9 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC34.66■■■■□ 3.14
Erich3F6QRE9 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Erich3F6QRE9 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Erich3F6QRE9 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Erich3F6QRE9 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
Erich3F6QRE9 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Erich3F6QRE9 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC34.63■■■■□ 3.13
Erich3F6QRE9 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Erich3F6QRE9 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
Erich3F6QRE9 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Erich3F6QRE9 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Erich3F6QRE9 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
Erich3F6QRE9 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Erich3F6QRE9 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC34.62■■■■□ 3.13
Erich3F6QRE9 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC34.61■■■■□ 3.13
Erich3F6QRE9 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Erich3F6QRE9 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.61■■■■□ 3.13
Erich3F6QRE9 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
Erich3F6QRE9 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
Erich3F6QRE9 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC34.6■■■■□ 3.13
Erich3F6QRE9 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC34.6■■■■□ 3.13
Erich3F6QRE9 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
Erich3F6QRE9 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.59■■■■□ 3.13
Erich3F6QRE9 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Erich3F6QRE9 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC34.59■■■■□ 3.13
Erich3F6QRE9 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC34.59■■■■□ 3.13
Erich3F6QRE9 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Erich3F6QRE9 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Erich3F6QRE9 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Erich3F6QRE9 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Erich3F6QRE9 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Erich3F6QRE9 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC34.57■■■■□ 3.13
Erich3F6QRE9 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.57■■■■□ 3.12
Erich3F6QRE9 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
Erich3F6QRE9 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.12
Erich3F6QRE9 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC34.56■■■■□ 3.12
Erich3F6QRE9 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC34.56■■■■□ 3.12
Erich3F6QRE9 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Erich3F6QRE9 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Erich3F6QRE9 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Erich3F6QRE9 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC34.55■■■■□ 3.12
Erich3F6QRE9 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Erich3F6QRE9 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Erich3F6QRE9 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Erich3F6QRE9 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Erich3F6QRE9 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Erich3F6QRE9 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Erich3F6QRE9 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Erich3F6QRE9 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Erich3F6QRE9 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Erich3F6QRE9 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Erich3F6QRE9 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Erich3F6QRE9 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Erich3F6QRE9 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.52■■■■□ 3.12
Erich3F6QRE9 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC34.52■■■■□ 3.12
Erich3F6QRE9 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC34.51■■■■□ 3.12
Erich3F6QRE9 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
Erich3F6QRE9 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
Erich3F6QRE9 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Erich3F6QRE9 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC34.5■■■■□ 3.11
Erich3F6QRE9 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Erich3F6QRE9 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Erich3F6QRE9 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Erich3F6QRE9 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
Erich3F6QRE9 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
Erich3F6QRE9 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Erich3F6QRE9 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
Erich3F6QRE9 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Erich3F6QRE9 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
Erich3F6QRE9 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC34.48■■■■□ 3.11
Erich3F6QRE9 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Erich3F6QRE9 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Erich3F6QRE9 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Erich3F6QRE9 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
Erich3F6QRE9 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
Erich3F6QRE9 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Erich3F6QRE9 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Erich3F6QRE9 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Erich3F6QRE9 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Erich3F6QRE9 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Erich3F6QRE9 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC34.44■■■■□ 3.1
Erich3F6QRE9 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC34.44■■■■□ 3.1
Erich3F6QRE9 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Erich3F6QRE9 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Erich3F6QRE9 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
Erich3F6QRE9 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms