Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6Y8

Usp31, Ubiquitin-specific peptidase 31, mousemouse

Predictions only

Length 1,344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp31E9Q6Y8 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Usp31E9Q6Y8 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Usp31E9Q6Y8 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Usp31E9Q6Y8 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Usp31E9Q6Y8 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Usp31E9Q6Y8 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Usp31E9Q6Y8 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Usp31E9Q6Y8 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Usp31E9Q6Y8 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Usp31E9Q6Y8 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Usp31E9Q6Y8 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Usp31E9Q6Y8 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Usp31E9Q6Y8 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Usp31E9Q6Y8 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Usp31E9Q6Y8 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Usp31E9Q6Y8 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Usp31E9Q6Y8 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Usp31E9Q6Y8 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Usp31E9Q6Y8 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Usp31E9Q6Y8 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Usp31E9Q6Y8 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Usp31E9Q6Y8 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Usp31E9Q6Y8 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Usp31E9Q6Y8 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Usp31E9Q6Y8 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Usp31E9Q6Y8 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Usp31E9Q6Y8 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Usp31E9Q6Y8 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Usp31E9Q6Y8 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Usp31E9Q6Y8 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Usp31E9Q6Y8 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Usp31E9Q6Y8 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Usp31E9Q6Y8 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Usp31E9Q6Y8 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Usp31E9Q6Y8 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Usp31E9Q6Y8 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Usp31E9Q6Y8 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Usp31E9Q6Y8 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Usp31E9Q6Y8 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Usp31E9Q6Y8 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Usp31E9Q6Y8 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Usp31E9Q6Y8 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Usp31E9Q6Y8 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Usp31E9Q6Y8 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Usp31E9Q6Y8 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Usp31E9Q6Y8 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Usp31E9Q6Y8 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Usp31E9Q6Y8 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Usp31E9Q6Y8 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Usp31E9Q6Y8 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Usp31E9Q6Y8 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Usp31E9Q6Y8 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Usp31E9Q6Y8 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Usp31E9Q6Y8 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Usp31E9Q6Y8 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Usp31E9Q6Y8 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Usp31E9Q6Y8 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Usp31E9Q6Y8 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Usp31E9Q6Y8 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Usp31E9Q6Y8 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Usp31E9Q6Y8 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Usp31E9Q6Y8 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Usp31E9Q6Y8 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Usp31E9Q6Y8 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Usp31E9Q6Y8 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Usp31E9Q6Y8 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Usp31E9Q6Y8 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Usp31E9Q6Y8 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Usp31E9Q6Y8 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Usp31E9Q6Y8 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Usp31E9Q6Y8 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Usp31E9Q6Y8 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Usp31E9Q6Y8 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Usp31E9Q6Y8 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Usp31E9Q6Y8 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Usp31E9Q6Y8 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Usp31E9Q6Y8 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Usp31E9Q6Y8 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Usp31E9Q6Y8 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Usp31E9Q6Y8 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Usp31E9Q6Y8 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Usp31E9Q6Y8 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Usp31E9Q6Y8 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Usp31E9Q6Y8 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Usp31E9Q6Y8 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Usp31E9Q6Y8 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Usp31E9Q6Y8 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Usp31E9Q6Y8 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Usp31E9Q6Y8 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Usp31E9Q6Y8 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Usp31E9Q6Y8 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Usp31E9Q6Y8 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Usp31E9Q6Y8 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Usp31E9Q6Y8 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Usp31E9Q6Y8 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Usp31E9Q6Y8 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Usp31E9Q6Y8 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Usp31E9Q6Y8 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Usp31E9Q6Y8 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Usp31E9Q6Y8 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.1 ms