Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6L3

Vmn2r49, Vomeronasal 2, receptor 49, mousemouse

Predictions only

Length 852 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r49D3Z6L3 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Vmn2r49D3Z6L3 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Vmn2r49D3Z6L3 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Vmn2r49D3Z6L3 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vmn2r49D3Z6L3 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vmn2r49D3Z6L3 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vmn2r49D3Z6L3 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vmn2r49D3Z6L3 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vmn2r49D3Z6L3 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vmn2r49D3Z6L3 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vmn2r49D3Z6L3 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vmn2r49D3Z6L3 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Vmn2r49D3Z6L3 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Vmn2r49D3Z6L3 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Vmn2r49D3Z6L3 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Vmn2r49D3Z6L3 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Vmn2r49D3Z6L3 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Vmn2r49D3Z6L3 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Vmn2r49D3Z6L3 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Vmn2r49D3Z6L3 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Vmn2r49D3Z6L3 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Vmn2r49D3Z6L3 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Vmn2r49D3Z6L3 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Vmn2r49D3Z6L3 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Vmn2r49D3Z6L3 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Vmn2r49D3Z6L3 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Vmn2r49D3Z6L3 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Vmn2r49D3Z6L3 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Vmn2r49D3Z6L3 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Vmn2r49D3Z6L3 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Vmn2r49D3Z6L3 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Vmn2r49D3Z6L3 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Vmn2r49D3Z6L3 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Vmn2r49D3Z6L3 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Vmn2r49D3Z6L3 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Vmn2r49D3Z6L3 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Vmn2r49D3Z6L3 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Vmn2r49D3Z6L3 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Vmn2r49D3Z6L3 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Vmn2r49D3Z6L3 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Vmn2r49D3Z6L3 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Vmn2r49D3Z6L3 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Vmn2r49D3Z6L3 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Vmn2r49D3Z6L3 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Vmn2r49D3Z6L3 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Vmn2r49D3Z6L3 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Vmn2r49D3Z6L3 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Vmn2r49D3Z6L3 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Vmn2r49D3Z6L3 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Vmn2r49D3Z6L3 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Vmn2r49D3Z6L3 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Vmn2r49D3Z6L3 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Vmn2r49D3Z6L3 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Vmn2r49D3Z6L3 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Vmn2r49D3Z6L3 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Vmn2r49D3Z6L3 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Vmn2r49D3Z6L3 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Vmn2r49D3Z6L3 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vmn2r49D3Z6L3 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vmn2r49D3Z6L3 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vmn2r49D3Z6L3 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vmn2r49D3Z6L3 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vmn2r49D3Z6L3 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vmn2r49D3Z6L3 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vmn2r49D3Z6L3 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vmn2r49D3Z6L3 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vmn2r49D3Z6L3 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vmn2r49D3Z6L3 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Vmn2r49D3Z6L3 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vmn2r49D3Z6L3 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vmn2r49D3Z6L3 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Vmn2r49D3Z6L3 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vmn2r49D3Z6L3 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vmn2r49D3Z6L3 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vmn2r49D3Z6L3 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vmn2r49D3Z6L3 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vmn2r49D3Z6L3 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vmn2r49D3Z6L3 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vmn2r49D3Z6L3 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vmn2r49D3Z6L3 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vmn2r49D3Z6L3 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vmn2r49D3Z6L3 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vmn2r49D3Z6L3 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vmn2r49D3Z6L3 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vmn2r49D3Z6L3 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vmn2r49D3Z6L3 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vmn2r49D3Z6L3 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vmn2r49D3Z6L3 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vmn2r49D3Z6L3 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vmn2r49D3Z6L3 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vmn2r49D3Z6L3 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vmn2r49D3Z6L3 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vmn2r49D3Z6L3 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vmn2r49D3Z6L3 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vmn2r49D3Z6L3 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vmn2r49D3Z6L3 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vmn2r49D3Z6L3 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vmn2r49D3Z6L3 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Vmn2r49D3Z6L3 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vmn2r49D3Z6L3 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms