Protein–RNA interactions for Protein: D3Z5F7

Gm20521, Predicted gene 20521, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20521D3Z5F7 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
Gm20521D3Z5F7 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
Gm20521D3Z5F7 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Gm20521D3Z5F7 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC31.1■■■□□ 2.57
Gm20521D3Z5F7 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Gm20521D3Z5F7 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Gm20521D3Z5F7 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
Gm20521D3Z5F7 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC31.09■■■□□ 2.57
Gm20521D3Z5F7 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Gm20521D3Z5F7 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Gm20521D3Z5F7 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
Gm20521D3Z5F7 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Gm20521D3Z5F7 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
Gm20521D3Z5F7 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
Gm20521D3Z5F7 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
Gm20521D3Z5F7 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Gm20521D3Z5F7 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
Gm20521D3Z5F7 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Gm20521D3Z5F7 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Gm20521D3Z5F7 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC31.06■■■□□ 2.56
Gm20521D3Z5F7 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC31.06■■■□□ 2.56
Gm20521D3Z5F7 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Gm20521D3Z5F7 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Gm20521D3Z5F7 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC31.05■■■□□ 2.56
Gm20521D3Z5F7 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Gm20521D3Z5F7 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
Gm20521D3Z5F7 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Gm20521D3Z5F7 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Gm20521D3Z5F7 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Gm20521D3Z5F7 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
Gm20521D3Z5F7 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Gm20521D3Z5F7 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Gm20521D3Z5F7 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC31.03■■■□□ 2.56
Gm20521D3Z5F7 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
Gm20521D3Z5F7 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Gm20521D3Z5F7 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC31.02■■■□□ 2.56
Gm20521D3Z5F7 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Gm20521D3Z5F7 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Gm20521D3Z5F7 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC31.02■■■□□ 2.56
Gm20521D3Z5F7 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
Gm20521D3Z5F7 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Gm20521D3Z5F7 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Gm20521D3Z5F7 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Gm20521D3Z5F7 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Gm20521D3Z5F7 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Gm20521D3Z5F7 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Gm20521D3Z5F7 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Gm20521D3Z5F7 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Gm20521D3Z5F7 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Gm20521D3Z5F7 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Gm20521D3Z5F7 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Gm20521D3Z5F7 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Gm20521D3Z5F7 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Gm20521D3Z5F7 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Gm20521D3Z5F7 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
Gm20521D3Z5F7 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Gm20521D3Z5F7 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Gm20521D3Z5F7 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Gm20521D3Z5F7 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
Gm20521D3Z5F7 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
Gm20521D3Z5F7 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC30.96■■■□□ 2.55
Gm20521D3Z5F7 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Gm20521D3Z5F7 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.54
Gm20521D3Z5F7 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
Gm20521D3Z5F7 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
Gm20521D3Z5F7 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC30.94■■■□□ 2.54
Gm20521D3Z5F7 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Gm20521D3Z5F7 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Gm20521D3Z5F7 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
Gm20521D3Z5F7 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Gm20521D3Z5F7 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Gm20521D3Z5F7 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
Gm20521D3Z5F7 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
Gm20521D3Z5F7 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Gm20521D3Z5F7 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Gm20521D3Z5F7 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
Gm20521D3Z5F7 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Gm20521D3Z5F7 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
Gm20521D3Z5F7 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
Gm20521D3Z5F7 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
Gm20521D3Z5F7 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Gm20521D3Z5F7 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Gm20521D3Z5F7 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC30.89■■■□□ 2.54
Gm20521D3Z5F7 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Gm20521D3Z5F7 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC30.88■■■□□ 2.53
Gm20521D3Z5F7 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Gm20521D3Z5F7 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
Gm20521D3Z5F7 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
Gm20521D3Z5F7 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Gm20521D3Z5F7 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Gm20521D3Z5F7 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.87■■■□□ 2.53
Gm20521D3Z5F7 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC30.87■■■□□ 2.53
Gm20521D3Z5F7 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC30.87■■■□□ 2.53
Gm20521D3Z5F7 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Gm20521D3Z5F7 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Gm20521D3Z5F7 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
Gm20521D3Z5F7 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Gm20521D3Z5F7 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
Gm20521D3Z5F7 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Gm20521D3Z5F7 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.8 ms