Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms