Protein–RNA interactions for Protein: D3YWB7

Gm4297, Predicted gene 4297, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm4297D3YWB7 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm4297D3YWB7 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm4297D3YWB7 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm4297D3YWB7 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm4297D3YWB7 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm4297D3YWB7 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm4297D3YWB7 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm4297D3YWB7 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm4297D3YWB7 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm4297D3YWB7 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm4297D3YWB7 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm4297D3YWB7 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm4297D3YWB7 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm4297D3YWB7 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm4297D3YWB7 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm4297D3YWB7 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm4297D3YWB7 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm4297D3YWB7 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm4297D3YWB7 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm4297D3YWB7 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm4297D3YWB7 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm4297D3YWB7 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm4297D3YWB7 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm4297D3YWB7 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm4297D3YWB7 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm4297D3YWB7 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm4297D3YWB7 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm4297D3YWB7 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm4297D3YWB7 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm4297D3YWB7 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm4297D3YWB7 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm4297D3YWB7 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm4297D3YWB7 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm4297D3YWB7 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm4297D3YWB7 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm4297D3YWB7 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm4297D3YWB7 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm4297D3YWB7 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm4297D3YWB7 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm4297D3YWB7 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm4297D3YWB7 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm4297D3YWB7 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm4297D3YWB7 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm4297D3YWB7 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm4297D3YWB7 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm4297D3YWB7 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm4297D3YWB7 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm4297D3YWB7 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gm4297D3YWB7 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gm4297D3YWB7 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gm4297D3YWB7 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gm4297D3YWB7 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Gm4297D3YWB7 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gm4297D3YWB7 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Gm4297D3YWB7 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gm4297D3YWB7 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gm4297D3YWB7 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gm4297D3YWB7 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm4297D3YWB7 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm4297D3YWB7 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm4297D3YWB7 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm4297D3YWB7 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm4297D3YWB7 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm4297D3YWB7 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm4297D3YWB7 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm4297D3YWB7 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm4297D3YWB7 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm4297D3YWB7 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm4297D3YWB7 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm4297D3YWB7 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm4297D3YWB7 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm4297D3YWB7 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm4297D3YWB7 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm4297D3YWB7 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm4297D3YWB7 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm4297D3YWB7 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm4297D3YWB7 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm4297D3YWB7 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm4297D3YWB7 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm4297D3YWB7 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm4297D3YWB7 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm4297D3YWB7 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm4297D3YWB7 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm4297D3YWB7 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm4297D3YWB7 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm4297D3YWB7 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm4297D3YWB7 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm4297D3YWB7 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm4297D3YWB7 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm4297D3YWB7 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm4297D3YWB7 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Gm4297D3YWB7 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Gm4297D3YWB7 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gm4297D3YWB7 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Gm4297D3YWB7 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm4297D3YWB7 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm4297D3YWB7 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm4297D3YWB7 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm4297D3YWB7 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm4297D3YWB7 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.7 ms