Protein–RNA interactions for Protein: C3VPR6

Nlrc5, Protein NLRC5, mousemouse

Predictions only

Length 1,915 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc5C3VPR6 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nlrc5C3VPR6 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nlrc5C3VPR6 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nlrc5C3VPR6 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nlrc5C3VPR6 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nlrc5C3VPR6 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nlrc5C3VPR6 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nlrc5C3VPR6 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nlrc5C3VPR6 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Nlrc5C3VPR6 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nlrc5C3VPR6 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Nlrc5C3VPR6 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Nlrc5C3VPR6 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Nlrc5C3VPR6 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Nlrc5C3VPR6 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Nlrc5C3VPR6 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Nlrc5C3VPR6 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nlrc5C3VPR6 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Nlrc5C3VPR6 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nlrc5C3VPR6 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nlrc5C3VPR6 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nlrc5C3VPR6 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nlrc5C3VPR6 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nlrc5C3VPR6 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nlrc5C3VPR6 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nlrc5C3VPR6 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nlrc5C3VPR6 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Nlrc5C3VPR6 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nlrc5C3VPR6 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nlrc5C3VPR6 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nlrc5C3VPR6 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nlrc5C3VPR6 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nlrc5C3VPR6 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nlrc5C3VPR6 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nlrc5C3VPR6 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nlrc5C3VPR6 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Nlrc5C3VPR6 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nlrc5C3VPR6 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nlrc5C3VPR6 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nlrc5C3VPR6 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nlrc5C3VPR6 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Nlrc5C3VPR6 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Nlrc5C3VPR6 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nlrc5C3VPR6 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nlrc5C3VPR6 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nlrc5C3VPR6 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Nlrc5C3VPR6 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nlrc5C3VPR6 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nlrc5C3VPR6 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nlrc5C3VPR6 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nlrc5C3VPR6 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nlrc5C3VPR6 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Nlrc5C3VPR6 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nlrc5C3VPR6 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nlrc5C3VPR6 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nlrc5C3VPR6 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nlrc5C3VPR6 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nlrc5C3VPR6 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nlrc5C3VPR6 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nlrc5C3VPR6 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nlrc5C3VPR6 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nlrc5C3VPR6 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nlrc5C3VPR6 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nlrc5C3VPR6 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nlrc5C3VPR6 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nlrc5C3VPR6 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nlrc5C3VPR6 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nlrc5C3VPR6 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nlrc5C3VPR6 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nlrc5C3VPR6 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nlrc5C3VPR6 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Nlrc5C3VPR6 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nlrc5C3VPR6 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nlrc5C3VPR6 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nlrc5C3VPR6 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nlrc5C3VPR6 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nlrc5C3VPR6 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nlrc5C3VPR6 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nlrc5C3VPR6 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nlrc5C3VPR6 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Nlrc5C3VPR6 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Nlrc5C3VPR6 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nlrc5C3VPR6 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nlrc5C3VPR6 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nlrc5C3VPR6 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nlrc5C3VPR6 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nlrc5C3VPR6 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Nlrc5C3VPR6 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
Nlrc5C3VPR6 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Nlrc5C3VPR6 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nlrc5C3VPR6 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nlrc5C3VPR6 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nlrc5C3VPR6 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nlrc5C3VPR6 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nlrc5C3VPR6 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nlrc5C3VPR6 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Nlrc5C3VPR6 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nlrc5C3VPR6 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nlrc5C3VPR6 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nlrc5C3VPR6 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms